Protein–RNA interactions for Protein: P61758

VBP1, Prefoldin subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VBP1P61758 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
VBP1P61758 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
VBP1P61758 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
VBP1P61758 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
VBP1P61758 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
VBP1P61758 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
VBP1P61758 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
VBP1P61758 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
VBP1P61758 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
VBP1P61758 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
VBP1P61758 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
VBP1P61758 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
VBP1P61758 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
VBP1P61758 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
VBP1P61758 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
VBP1P61758 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
VBP1P61758 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC18.63■□□□□ 0.57
VBP1P61758 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
VBP1P61758 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
VBP1P61758 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
VBP1P61758 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
VBP1P61758 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
VBP1P61758 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
VBP1P61758 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
VBP1P61758 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
VBP1P61758 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
VBP1P61758 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
VBP1P61758 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
VBP1P61758 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
VBP1P61758 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
VBP1P61758 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
VBP1P61758 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
VBP1P61758 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
VBP1P61758 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
VBP1P61758 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
VBP1P61758 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
VBP1P61758 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
VBP1P61758 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
VBP1P61758 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
VBP1P61758 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
VBP1P61758 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
VBP1P61758 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
VBP1P61758 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
VBP1P61758 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
VBP1P61758 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
VBP1P61758 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
VBP1P61758 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
VBP1P61758 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
VBP1P61758 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
VBP1P61758 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
VBP1P61758 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
VBP1P61758 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
VBP1P61758 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
VBP1P61758 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
VBP1P61758 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
VBP1P61758 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
VBP1P61758 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
VBP1P61758 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
VBP1P61758 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
VBP1P61758 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
VBP1P61758 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
VBP1P61758 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
VBP1P61758 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
VBP1P61758 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
VBP1P61758 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
VBP1P61758 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
VBP1P61758 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
VBP1P61758 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
VBP1P61758 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
VBP1P61758 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
VBP1P61758 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
VBP1P61758 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
VBP1P61758 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
VBP1P61758 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
VBP1P61758 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
VBP1P61758 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
VBP1P61758 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
VBP1P61758 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
VBP1P61758 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
VBP1P61758 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
VBP1P61758 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
VBP1P61758 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
VBP1P61758 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
VBP1P61758 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
VBP1P61758 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
VBP1P61758 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
VBP1P61758 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
VBP1P61758 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
VBP1P61758 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
VBP1P61758 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
VBP1P61758 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
VBP1P61758 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
VBP1P61758 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
VBP1P61758 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
VBP1P61758 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
VBP1P61758 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
VBP1P61758 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
VBP1P61758 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
VBP1P61758 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
VBP1P61758 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms