Protein–RNA interactions for Protein: P60510

PPP4C, Serine/threonine-protein phosphatase 4 catalytic subunit, humanhuman

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP4CP60510 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
PPP4CP60510 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PPP4CP60510 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PPP4CP60510 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PPP4CP60510 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PPP4CP60510 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PPP4CP60510 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PPP4CP60510 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PPP4CP60510 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PPP4CP60510 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
PPP4CP60510 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PPP4CP60510 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PPP4CP60510 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PPP4CP60510 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PPP4CP60510 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PPP4CP60510 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PPP4CP60510 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PPP4CP60510 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PPP4CP60510 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PPP4CP60510 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PPP4CP60510 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PPP4CP60510 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PPP4CP60510 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PPP4CP60510 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PPP4CP60510 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PPP4CP60510 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PPP4CP60510 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PPP4CP60510 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PPP4CP60510 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PPP4CP60510 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PPP4CP60510 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PPP4CP60510 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PPP4CP60510 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PPP4CP60510 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PPP4CP60510 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PPP4CP60510 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PPP4CP60510 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PPP4CP60510 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PPP4CP60510 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PPP4CP60510 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PPP4CP60510 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PPP4CP60510 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PPP4CP60510 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
PPP4CP60510 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PPP4CP60510 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
PPP4CP60510 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PPP4CP60510 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PPP4CP60510 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PPP4CP60510 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PPP4CP60510 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PPP4CP60510 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PPP4CP60510 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PPP4CP60510 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PPP4CP60510 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PPP4CP60510 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PPP4CP60510 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PPP4CP60510 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PPP4CP60510 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PPP4CP60510 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PPP4CP60510 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
PPP4CP60510 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PPP4CP60510 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PPP4CP60510 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
PPP4CP60510 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PPP4CP60510 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PPP4CP60510 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PPP4CP60510 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PPP4CP60510 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
PPP4CP60510 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PPP4CP60510 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PPP4CP60510 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PPP4CP60510 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PPP4CP60510 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
PPP4CP60510 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PPP4CP60510 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PPP4CP60510 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PPP4CP60510 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PPP4CP60510 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PPP4CP60510 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PPP4CP60510 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PPP4CP60510 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PPP4CP60510 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PPP4CP60510 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PPP4CP60510 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PPP4CP60510 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PPP4CP60510 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PPP4CP60510 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PPP4CP60510 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
PPP4CP60510 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PPP4CP60510 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PPP4CP60510 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PPP4CP60510 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
PPP4CP60510 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PPP4CP60510 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PPP4CP60510 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PPP4CP60510 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PPP4CP60510 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PPP4CP60510 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PPP4CP60510 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PPP4CP60510 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms