Protein–RNA interactions for Protein: P59037

LINC00313, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00313, humanhuman

Predictions only

Length 77 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00313P59037 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
LINC00313P59037 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
LINC00313P59037 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
LINC00313P59037 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
LINC00313P59037 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
LINC00313P59037 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
LINC00313P59037 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
LINC00313P59037 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
LINC00313P59037 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
LINC00313P59037 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
LINC00313P59037 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
LINC00313P59037 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
LINC00313P59037 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
LINC00313P59037 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
LINC00313P59037 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
LINC00313P59037 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
LINC00313P59037 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
LINC00313P59037 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
LINC00313P59037 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
LINC00313P59037 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
LINC00313P59037 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
LINC00313P59037 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
LINC00313P59037 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
LINC00313P59037 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
LINC00313P59037 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
LINC00313P59037 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
LINC00313P59037 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC11.83□□□□□ -0.52
LINC00313P59037 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.83□□□□□ -0.52
LINC00313P59037 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
LINC00313P59037 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
LINC00313P59037 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
LINC00313P59037 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
LINC00313P59037 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
LINC00313P59037 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
LINC00313P59037 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
LINC00313P59037 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
LINC00313P59037 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
LINC00313P59037 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.82□□□□□ -0.52
LINC00313P59037 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
LINC00313P59037 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
LINC00313P59037 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
LINC00313P59037 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
LINC00313P59037 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
LINC00313P59037 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
LINC00313P59037 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
LINC00313P59037 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
LINC00313P59037 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
LINC00313P59037 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
LINC00313P59037 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
LINC00313P59037 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
LINC00313P59037 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
LINC00313P59037 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
LINC00313P59037 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
LINC00313P59037 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
LINC00313P59037 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
LINC00313P59037 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
LINC00313P59037 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
LINC00313P59037 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
LINC00313P59037 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
LINC00313P59037 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
LINC00313P59037 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
LINC00313P59037 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
LINC00313P59037 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
LINC00313P59037 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
LINC00313P59037 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
LINC00313P59037 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
LINC00313P59037 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
LINC00313P59037 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
LINC00313P59037 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
LINC00313P59037 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
LINC00313P59037 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
LINC00313P59037 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
LINC00313P59037 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
LINC00313P59037 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
LINC00313P59037 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
LINC00313P59037 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
LINC00313P59037 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
LINC00313P59037 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
LINC00313P59037 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
LINC00313P59037 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
LINC00313P59037 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
LINC00313P59037 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
LINC00313P59037 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
LINC00313P59037 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
LINC00313P59037 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
LINC00313P59037 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
LINC00313P59037 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
LINC00313P59037 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
LINC00313P59037 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
LINC00313P59037 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
LINC00313P59037 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
LINC00313P59037 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
LINC00313P59037 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
LINC00313P59037 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
LINC00313P59037 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
LINC00313P59037 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC11.81□□□□□ -0.52
LINC00313P59037 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
LINC00313P59037 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
LINC00313P59037 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
LINC00313P59037 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms