Protein–RNA interactions for Protein: P59025

RTP1, Receptor-transporting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTP1P59025 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RTP1P59025 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RTP1P59025 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RTP1P59025 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RTP1P59025 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RTP1P59025 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RTP1P59025 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RTP1P59025 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
RTP1P59025 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RTP1P59025 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RTP1P59025 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RTP1P59025 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RTP1P59025 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
RTP1P59025 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RTP1P59025 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RTP1P59025 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RTP1P59025 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RTP1P59025 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
RTP1P59025 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
RTP1P59025 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RTP1P59025 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RTP1P59025 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RTP1P59025 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RTP1P59025 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RTP1P59025 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
RTP1P59025 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RTP1P59025 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RTP1P59025 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RTP1P59025 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RTP1P59025 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RTP1P59025 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RTP1P59025 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
RTP1P59025 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RTP1P59025 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RTP1P59025 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RTP1P59025 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RTP1P59025 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RTP1P59025 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RTP1P59025 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RTP1P59025 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RTP1P59025 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RTP1P59025 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RTP1P59025 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RTP1P59025 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RTP1P59025 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RTP1P59025 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
RTP1P59025 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RTP1P59025 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RTP1P59025 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RTP1P59025 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RTP1P59025 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
RTP1P59025 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RTP1P59025 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
RTP1P59025 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
RTP1P59025 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RTP1P59025 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RTP1P59025 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RTP1P59025 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RTP1P59025 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RTP1P59025 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RTP1P59025 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RTP1P59025 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
RTP1P59025 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
RTP1P59025 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RTP1P59025 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RTP1P59025 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RTP1P59025 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
RTP1P59025 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RTP1P59025 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RTP1P59025 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RTP1P59025 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RTP1P59025 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RTP1P59025 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
RTP1P59025 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RTP1P59025 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RTP1P59025 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RTP1P59025 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RTP1P59025 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RTP1P59025 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RTP1P59025 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RTP1P59025 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RTP1P59025 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RTP1P59025 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RTP1P59025 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RTP1P59025 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RTP1P59025 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RTP1P59025 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RTP1P59025 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RTP1P59025 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RTP1P59025 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RTP1P59025 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RTP1P59025 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RTP1P59025 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RTP1P59025 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RTP1P59025 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RTP1P59025 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RTP1P59025 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RTP1P59025 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RTP1P59025 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RTP1P59025 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms