Protein–RNA interactions for Protein: P58872

RHBDL3, Rhomboid-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHBDL3P58872 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RHBDL3P58872 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RHBDL3P58872 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RHBDL3P58872 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RHBDL3P58872 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RHBDL3P58872 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RHBDL3P58872 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RHBDL3P58872 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RHBDL3P58872 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RHBDL3P58872 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RHBDL3P58872 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RHBDL3P58872 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RHBDL3P58872 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RHBDL3P58872 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RHBDL3P58872 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RHBDL3P58872 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RHBDL3P58872 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RHBDL3P58872 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RHBDL3P58872 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RHBDL3P58872 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RHBDL3P58872 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RHBDL3P58872 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RHBDL3P58872 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RHBDL3P58872 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
RHBDL3P58872 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RHBDL3P58872 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RHBDL3P58872 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RHBDL3P58872 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RHBDL3P58872 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RHBDL3P58872 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RHBDL3P58872 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RHBDL3P58872 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RHBDL3P58872 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RHBDL3P58872 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RHBDL3P58872 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RHBDL3P58872 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RHBDL3P58872 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RHBDL3P58872 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RHBDL3P58872 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RHBDL3P58872 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RHBDL3P58872 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RHBDL3P58872 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RHBDL3P58872 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RHBDL3P58872 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RHBDL3P58872 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RHBDL3P58872 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
RHBDL3P58872 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RHBDL3P58872 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RHBDL3P58872 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RHBDL3P58872 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RHBDL3P58872 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RHBDL3P58872 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RHBDL3P58872 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RHBDL3P58872 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RHBDL3P58872 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RHBDL3P58872 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RHBDL3P58872 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RHBDL3P58872 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RHBDL3P58872 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
RHBDL3P58872 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RHBDL3P58872 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RHBDL3P58872 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
RHBDL3P58872 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RHBDL3P58872 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RHBDL3P58872 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RHBDL3P58872 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RHBDL3P58872 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RHBDL3P58872 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RHBDL3P58872 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RHBDL3P58872 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RHBDL3P58872 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RHBDL3P58872 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RHBDL3P58872 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RHBDL3P58872 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RHBDL3P58872 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RHBDL3P58872 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
RHBDL3P58872 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RHBDL3P58872 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RHBDL3P58872 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
RHBDL3P58872 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RHBDL3P58872 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RHBDL3P58872 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RHBDL3P58872 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RHBDL3P58872 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RHBDL3P58872 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RHBDL3P58872 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RHBDL3P58872 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RHBDL3P58872 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RHBDL3P58872 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RHBDL3P58872 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RHBDL3P58872 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RHBDL3P58872 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RHBDL3P58872 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RHBDL3P58872 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RHBDL3P58872 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RHBDL3P58872 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC24.7■■□□□ 1.55
RHBDL3P58872 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
RHBDL3P58872 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RHBDL3P58872 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
RHBDL3P58872 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.8 ms