Protein–RNA interactions for Protein: P55196

AFDN, Afadin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,824 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AFDNP55196 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
AFDNP55196 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
AFDNP55196 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
AFDNP55196 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
AFDNP55196 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
AFDNP55196 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
AFDNP55196 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
AFDNP55196 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
AFDNP55196 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
AFDNP55196 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
AFDNP55196 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
AFDNP55196 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
AFDNP55196 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
AFDNP55196 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
AFDNP55196 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC26.42■■□□□ 1.82
AFDNP55196 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
AFDNP55196 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC26.42■■□□□ 1.82
AFDNP55196 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
AFDNP55196 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
AFDNP55196 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
AFDNP55196 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
AFDNP55196 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
AFDNP55196 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
AFDNP55196 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
AFDNP55196 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
AFDNP55196 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
AFDNP55196 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
AFDNP55196 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
AFDNP55196 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
AFDNP55196 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
AFDNP55196 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
AFDNP55196 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
AFDNP55196 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
AFDNP55196 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
AFDNP55196 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
AFDNP55196 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
AFDNP55196 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
AFDNP55196 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
AFDNP55196 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
AFDNP55196 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
AFDNP55196 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
AFDNP55196 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
AFDNP55196 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
AFDNP55196 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
AFDNP55196 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
AFDNP55196 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
AFDNP55196 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
AFDNP55196 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
AFDNP55196 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
AFDNP55196 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
AFDNP55196 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
AFDNP55196 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
AFDNP55196 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
AFDNP55196 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
AFDNP55196 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
AFDNP55196 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC26.39■■□□□ 1.81
AFDNP55196 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
AFDNP55196 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC26.39■■□□□ 1.81
AFDNP55196 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
AFDNP55196 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
AFDNP55196 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
AFDNP55196 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
AFDNP55196 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
AFDNP55196 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
AFDNP55196 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
AFDNP55196 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC26.38■■□□□ 1.81
AFDNP55196 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
AFDNP55196 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
AFDNP55196 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
AFDNP55196 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC26.38■■□□□ 1.81
AFDNP55196 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
AFDNP55196 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
AFDNP55196 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
AFDNP55196 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
AFDNP55196 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
AFDNP55196 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
AFDNP55196 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
AFDNP55196 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
AFDNP55196 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
AFDNP55196 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
AFDNP55196 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
AFDNP55196 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
AFDNP55196 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
AFDNP55196 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
AFDNP55196 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
AFDNP55196 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
AFDNP55196 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
AFDNP55196 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
AFDNP55196 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
AFDNP55196 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
AFDNP55196 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
AFDNP55196 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
AFDNP55196 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
AFDNP55196 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
AFDNP55196 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
AFDNP55196 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
AFDNP55196 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
AFDNP55196 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
AFDNP55196 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
AFDNP55196 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms