Protein–RNA interactions for Protein: P54849

EMP1, Epithelial membrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 157 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EMP1P54849 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EMP1P54849 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EMP1P54849 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EMP1P54849 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EMP1P54849 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EMP1P54849 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EMP1P54849 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EMP1P54849 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EMP1P54849 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EMP1P54849 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EMP1P54849 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EMP1P54849 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
EMP1P54849 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EMP1P54849 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EMP1P54849 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EMP1P54849 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EMP1P54849 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EMP1P54849 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EMP1P54849 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EMP1P54849 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
EMP1P54849 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
EMP1P54849 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
EMP1P54849 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
EMP1P54849 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EMP1P54849 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
EMP1P54849 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
EMP1P54849 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
EMP1P54849 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EMP1P54849 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EMP1P54849 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EMP1P54849 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EMP1P54849 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
EMP1P54849 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
EMP1P54849 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
EMP1P54849 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EMP1P54849 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
EMP1P54849 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EMP1P54849 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
EMP1P54849 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
EMP1P54849 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
EMP1P54849 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
EMP1P54849 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
EMP1P54849 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
EMP1P54849 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
EMP1P54849 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
EMP1P54849 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
EMP1P54849 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
EMP1P54849 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
EMP1P54849 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
EMP1P54849 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
EMP1P54849 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
EMP1P54849 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
EMP1P54849 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
EMP1P54849 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
EMP1P54849 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
EMP1P54849 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
EMP1P54849 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
EMP1P54849 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
EMP1P54849 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
EMP1P54849 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
EMP1P54849 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
EMP1P54849 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
EMP1P54849 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
EMP1P54849 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
EMP1P54849 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
EMP1P54849 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
EMP1P54849 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
EMP1P54849 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
EMP1P54849 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
EMP1P54849 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
EMP1P54849 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
EMP1P54849 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
EMP1P54849 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
EMP1P54849 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
EMP1P54849 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
EMP1P54849 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
EMP1P54849 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
EMP1P54849 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
EMP1P54849 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
EMP1P54849 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
EMP1P54849 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
EMP1P54849 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
EMP1P54849 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
EMP1P54849 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
EMP1P54849 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
EMP1P54849 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
EMP1P54849 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
EMP1P54849 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
EMP1P54849 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
EMP1P54849 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
EMP1P54849 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
EMP1P54849 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
EMP1P54849 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
EMP1P54849 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
EMP1P54849 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
EMP1P54849 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
EMP1P54849 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
EMP1P54849 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
EMP1P54849 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
EMP1P54849 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms