Protein–RNA interactions for Protein: P54725

RAD23A, UV excision repair protein RAD23 homolog A, humanhuman

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD23AP54725 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
RAD23AP54725 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
RAD23AP54725 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
RAD23AP54725 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
RAD23AP54725 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
RAD23AP54725 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
RAD23AP54725 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
RAD23AP54725 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
RAD23AP54725 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
RAD23AP54725 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
RAD23AP54725 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
RAD23AP54725 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
RAD23AP54725 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
RAD23AP54725 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
RAD23AP54725 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
RAD23AP54725 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
RAD23AP54725 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
RAD23AP54725 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
RAD23AP54725 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
RAD23AP54725 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
RAD23AP54725 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
RAD23AP54725 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
RAD23AP54725 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
RAD23AP54725 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
RAD23AP54725 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
RAD23AP54725 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
RAD23AP54725 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
RAD23AP54725 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
RAD23AP54725 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
RAD23AP54725 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
RAD23AP54725 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
RAD23AP54725 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
RAD23AP54725 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
RAD23AP54725 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
RAD23AP54725 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
RAD23AP54725 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
RAD23AP54725 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
RAD23AP54725 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
RAD23AP54725 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
RAD23AP54725 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
RAD23AP54725 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
RAD23AP54725 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
RAD23AP54725 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
RAD23AP54725 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RAD23AP54725 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RAD23AP54725 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RAD23AP54725 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
RAD23AP54725 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
RAD23AP54725 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
RAD23AP54725 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RAD23AP54725 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
RAD23AP54725 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
RAD23AP54725 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RAD23AP54725 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RAD23AP54725 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
RAD23AP54725 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
RAD23AP54725 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
RAD23AP54725 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
RAD23AP54725 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RAD23AP54725 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
RAD23AP54725 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
RAD23AP54725 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RAD23AP54725 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
RAD23AP54725 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RAD23AP54725 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
RAD23AP54725 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
RAD23AP54725 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
RAD23AP54725 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RAD23AP54725 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
RAD23AP54725 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
RAD23AP54725 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RAD23AP54725 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RAD23AP54725 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RAD23AP54725 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RAD23AP54725 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RAD23AP54725 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RAD23AP54725 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RAD23AP54725 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
RAD23AP54725 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
RAD23AP54725 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RAD23AP54725 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
RAD23AP54725 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
RAD23AP54725 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
RAD23AP54725 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
RAD23AP54725 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
RAD23AP54725 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RAD23AP54725 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RAD23AP54725 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
RAD23AP54725 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
RAD23AP54725 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
RAD23AP54725 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
RAD23AP54725 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
RAD23AP54725 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
RAD23AP54725 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
RAD23AP54725 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
RAD23AP54725 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
RAD23AP54725 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
RAD23AP54725 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
RAD23AP54725 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
RAD23AP54725 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms