Protein–RNA interactions for Protein: P53814

SMTN, Smoothelin, humanhuman

Predictions only

Length 917 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMTNP53814 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SMTNP53814 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SMTNP53814 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SMTNP53814 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SMTNP53814 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SMTNP53814 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
SMTNP53814 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SMTNP53814 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SMTNP53814 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SMTNP53814 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SMTNP53814 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SMTNP53814 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SMTNP53814 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SMTNP53814 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SMTNP53814 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SMTNP53814 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SMTNP53814 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SMTNP53814 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SMTNP53814 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SMTNP53814 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SMTNP53814 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SMTNP53814 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SMTNP53814 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SMTNP53814 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SMTNP53814 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SMTNP53814 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
SMTNP53814 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SMTNP53814 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SMTNP53814 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SMTNP53814 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SMTNP53814 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SMTNP53814 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SMTNP53814 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SMTNP53814 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
SMTNP53814 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SMTNP53814 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SMTNP53814 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SMTNP53814 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SMTNP53814 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC23■■□□□ 1.27
SMTNP53814 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC23■■□□□ 1.27
SMTNP53814 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC23■■□□□ 1.27
SMTNP53814 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SMTNP53814 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SMTNP53814 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SMTNP53814 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SMTNP53814 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SMTNP53814 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SMTNP53814 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SMTNP53814 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SMTNP53814 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SMTNP53814 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SMTNP53814 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SMTNP53814 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SMTNP53814 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SMTNP53814 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SMTNP53814 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SMTNP53814 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
SMTNP53814 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SMTNP53814 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SMTNP53814 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SMTNP53814 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SMTNP53814 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SMTNP53814 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SMTNP53814 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
SMTNP53814 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SMTNP53814 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SMTNP53814 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SMTNP53814 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SMTNP53814 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SMTNP53814 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SMTNP53814 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SMTNP53814 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
SMTNP53814 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SMTNP53814 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SMTNP53814 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SMTNP53814 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SMTNP53814 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SMTNP53814 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SMTNP53814 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SMTNP53814 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SMTNP53814 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
SMTNP53814 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
SMTNP53814 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SMTNP53814 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SMTNP53814 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SMTNP53814 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SMTNP53814 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SMTNP53814 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SMTNP53814 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SMTNP53814 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SMTNP53814 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SMTNP53814 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SMTNP53814 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SMTNP53814 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SMTNP53814 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
SMTNP53814 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
SMTNP53814 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SMTNP53814 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SMTNP53814 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SMTNP53814 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 95.4 ms