Protein–RNA interactions for Protein: P53680

AP2S1, AP-2 complex subunit sigma, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP2S1P53680 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
AP2S1P53680 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
AP2S1P53680 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
AP2S1P53680 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
AP2S1P53680 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
AP2S1P53680 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.59■□□□□ 0.41
AP2S1P53680 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
AP2S1P53680 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
AP2S1P53680 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
AP2S1P53680 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
AP2S1P53680 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
AP2S1P53680 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
AP2S1P53680 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
AP2S1P53680 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
AP2S1P53680 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
AP2S1P53680 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
AP2S1P53680 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
AP2S1P53680 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
AP2S1P53680 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
AP2S1P53680 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
AP2S1P53680 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
AP2S1P53680 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
AP2S1P53680 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
AP2S1P53680 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
AP2S1P53680 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
AP2S1P53680 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
AP2S1P53680 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
AP2S1P53680 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
AP2S1P53680 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
AP2S1P53680 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
AP2S1P53680 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
AP2S1P53680 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
AP2S1P53680 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
AP2S1P53680 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
AP2S1P53680 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
AP2S1P53680 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
AP2S1P53680 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
AP2S1P53680 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
AP2S1P53680 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
AP2S1P53680 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
AP2S1P53680 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
AP2S1P53680 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
AP2S1P53680 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
AP2S1P53680 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
AP2S1P53680 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
AP2S1P53680 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
AP2S1P53680 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
AP2S1P53680 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
AP2S1P53680 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
AP2S1P53680 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
AP2S1P53680 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
AP2S1P53680 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
AP2S1P53680 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
AP2S1P53680 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
AP2S1P53680 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
AP2S1P53680 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
AP2S1P53680 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
AP2S1P53680 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
AP2S1P53680 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
AP2S1P53680 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
AP2S1P53680 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
AP2S1P53680 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
AP2S1P53680 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
AP2S1P53680 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
AP2S1P53680 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
AP2S1P53680 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
AP2S1P53680 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
AP2S1P53680 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
AP2S1P53680 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
AP2S1P53680 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
AP2S1P53680 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
AP2S1P53680 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
AP2S1P53680 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
AP2S1P53680 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
AP2S1P53680 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
AP2S1P53680 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
AP2S1P53680 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
AP2S1P53680 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
AP2S1P53680 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
AP2S1P53680 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
AP2S1P53680 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
AP2S1P53680 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
AP2S1P53680 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
AP2S1P53680 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
AP2S1P53680 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
AP2S1P53680 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
AP2S1P53680 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
AP2S1P53680 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
AP2S1P53680 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
AP2S1P53680 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
AP2S1P53680 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
AP2S1P53680 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
AP2S1P53680 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
AP2S1P53680 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
AP2S1P53680 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
AP2S1P53680 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
AP2S1P53680 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
AP2S1P53680 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
AP2S1P53680 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
AP2S1P53680 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms