Protein–RNA interactions for Protein: P52951

GBX2, Homeobox protein GBX-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBX2P52951 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GBX2P52951 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GBX2P52951 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GBX2P52951 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
GBX2P52951 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GBX2P52951 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GBX2P52951 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GBX2P52951 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GBX2P52951 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GBX2P52951 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
GBX2P52951 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GBX2P52951 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GBX2P52951 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GBX2P52951 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
GBX2P52951 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GBX2P52951 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GBX2P52951 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GBX2P52951 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GBX2P52951 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GBX2P52951 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GBX2P52951 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
GBX2P52951 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GBX2P52951 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GBX2P52951 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GBX2P52951 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GBX2P52951 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GBX2P52951 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GBX2P52951 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GBX2P52951 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GBX2P52951 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GBX2P52951 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GBX2P52951 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GBX2P52951 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GBX2P52951 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GBX2P52951 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GBX2P52951 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GBX2P52951 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GBX2P52951 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GBX2P52951 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
GBX2P52951 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GBX2P52951 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GBX2P52951 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GBX2P52951 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GBX2P52951 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GBX2P52951 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GBX2P52951 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GBX2P52951 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GBX2P52951 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GBX2P52951 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GBX2P52951 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GBX2P52951 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GBX2P52951 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GBX2P52951 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GBX2P52951 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GBX2P52951 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GBX2P52951 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GBX2P52951 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GBX2P52951 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GBX2P52951 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GBX2P52951 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GBX2P52951 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GBX2P52951 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GBX2P52951 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GBX2P52951 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GBX2P52951 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GBX2P52951 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
GBX2P52951 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
GBX2P52951 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GBX2P52951 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GBX2P52951 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GBX2P52951 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GBX2P52951 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GBX2P52951 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GBX2P52951 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GBX2P52951 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GBX2P52951 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GBX2P52951 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GBX2P52951 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GBX2P52951 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GBX2P52951 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
GBX2P52951 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GBX2P52951 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GBX2P52951 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GBX2P52951 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GBX2P52951 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GBX2P52951 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GBX2P52951 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GBX2P52951 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GBX2P52951 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GBX2P52951 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GBX2P52951 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GBX2P52951 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
GBX2P52951 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GBX2P52951 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GBX2P52951 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GBX2P52951 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GBX2P52951 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GBX2P52951 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GBX2P52951 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GBX2P52951 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms