Protein–RNA interactions for Protein: P51654

GPC3, Glypican-3, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPC3P51654 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GPC3P51654 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GPC3P51654 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
GPC3P51654 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GPC3P51654 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GPC3P51654 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GPC3P51654 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GPC3P51654 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GPC3P51654 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GPC3P51654 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GPC3P51654 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GPC3P51654 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GPC3P51654 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GPC3P51654 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
GPC3P51654 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GPC3P51654 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GPC3P51654 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GPC3P51654 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
GPC3P51654 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
GPC3P51654 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GPC3P51654 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GPC3P51654 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GPC3P51654 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GPC3P51654 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GPC3P51654 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GPC3P51654 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GPC3P51654 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GPC3P51654 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
GPC3P51654 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
GPC3P51654 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GPC3P51654 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GPC3P51654 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
GPC3P51654 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC23■■□□□ 1.27
GPC3P51654 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC23■■□□□ 1.27
GPC3P51654 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
GPC3P51654 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
GPC3P51654 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GPC3P51654 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GPC3P51654 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GPC3P51654 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GPC3P51654 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GPC3P51654 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
GPC3P51654 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GPC3P51654 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GPC3P51654 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GPC3P51654 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GPC3P51654 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GPC3P51654 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GPC3P51654 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GPC3P51654 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
GPC3P51654 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GPC3P51654 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GPC3P51654 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GPC3P51654 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GPC3P51654 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GPC3P51654 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GPC3P51654 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GPC3P51654 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GPC3P51654 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GPC3P51654 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GPC3P51654 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GPC3P51654 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GPC3P51654 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GPC3P51654 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GPC3P51654 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GPC3P51654 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GPC3P51654 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GPC3P51654 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GPC3P51654 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GPC3P51654 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GPC3P51654 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GPC3P51654 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GPC3P51654 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GPC3P51654 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GPC3P51654 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GPC3P51654 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GPC3P51654 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GPC3P51654 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GPC3P51654 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
GPC3P51654 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GPC3P51654 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
GPC3P51654 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GPC3P51654 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GPC3P51654 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GPC3P51654 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GPC3P51654 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GPC3P51654 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
GPC3P51654 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GPC3P51654 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GPC3P51654 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GPC3P51654 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GPC3P51654 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GPC3P51654 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GPC3P51654 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GPC3P51654 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GPC3P51654 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GPC3P51654 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GPC3P51654 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GPC3P51654 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GPC3P51654 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms