Protein–RNA interactions for Protein: P51532

SMARCA4, Transcription activator BRG1, humanhuman

Predictions only

Length 1,647 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCA4P51532 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC37.74■■■■□ 3.63
SMARCA4P51532 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC37.74■■■■□ 3.63
SMARCA4P51532 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.74■■■■□ 3.63
SMARCA4P51532 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.73■■■■□ 3.63
SMARCA4P51532 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.73■■■■□ 3.63
SMARCA4P51532 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.73■■■■□ 3.63
SMARCA4P51532 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.73■■■■□ 3.63
SMARCA4P51532 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC37.73■■■■□ 3.63
SMARCA4P51532 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC37.73■■■■□ 3.63
SMARCA4P51532 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC37.73■■■■□ 3.63
SMARCA4P51532 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC37.73■■■■□ 3.63
SMARCA4P51532 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC37.73■■■■□ 3.63
SMARCA4P51532 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.73■■■■□ 3.63
SMARCA4P51532 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC37.73■■■■□ 3.63
SMARCA4P51532 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC37.72■■■■□ 3.63
SMARCA4P51532 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC37.72■■■■□ 3.63
SMARCA4P51532 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC37.72■■■■□ 3.63
SMARCA4P51532 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC37.72■■■■□ 3.63
SMARCA4P51532 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.72■■■■□ 3.63
SMARCA4P51532 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC37.72■■■■□ 3.63
SMARCA4P51532 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC37.72■■■■□ 3.63
SMARCA4P51532 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.72■■■■□ 3.63
SMARCA4P51532 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC37.72■■■■□ 3.63
SMARCA4P51532 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC37.72■■■■□ 3.63
SMARCA4P51532 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC37.72■■■■□ 3.63
SMARCA4P51532 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.72■■■■□ 3.63
SMARCA4P51532 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.72■■■■□ 3.63
SMARCA4P51532 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.72■■■■□ 3.63
SMARCA4P51532 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC37.72■■■■□ 3.63
SMARCA4P51532 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.71■■■■□ 3.63
SMARCA4P51532 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.71■■■■□ 3.63
SMARCA4P51532 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC37.71■■■■□ 3.63
SMARCA4P51532 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC37.71■■■■□ 3.63
SMARCA4P51532 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.71■■■■□ 3.63
SMARCA4P51532 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC37.71■■■■□ 3.63
SMARCA4P51532 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC37.71■■■■□ 3.63
SMARCA4P51532 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC37.71■■■■□ 3.63
SMARCA4P51532 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC37.7■■■■□ 3.63
SMARCA4P51532 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.7■■■■□ 3.63
SMARCA4P51532 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.7■■■■□ 3.63
SMARCA4P51532 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.7■■■■□ 3.63
SMARCA4P51532 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC37.69■■■■□ 3.62
SMARCA4P51532 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC37.69■■■■□ 3.62
SMARCA4P51532 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.69■■■■□ 3.62
SMARCA4P51532 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.69■■■■□ 3.62
SMARCA4P51532 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC37.69■■■■□ 3.62
SMARCA4P51532 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.69■■■■□ 3.62
SMARCA4P51532 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC37.68■■■■□ 3.62
SMARCA4P51532 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC37.68■■■■□ 3.62
SMARCA4P51532 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC37.68■■■■□ 3.62
SMARCA4P51532 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC37.68■■■■□ 3.62
SMARCA4P51532 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.68■■■■□ 3.62
SMARCA4P51532 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC37.68■■■■□ 3.62
SMARCA4P51532 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC37.67■■■■□ 3.62
SMARCA4P51532 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC37.67■■■■□ 3.62
SMARCA4P51532 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC37.67■■■■□ 3.62
SMARCA4P51532 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC37.67■■■■□ 3.62
SMARCA4P51532 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.67■■■■□ 3.62
SMARCA4P51532 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC37.67■■■■□ 3.62
SMARCA4P51532 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC37.67■■■■□ 3.62
SMARCA4P51532 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.67■■■■□ 3.62
SMARCA4P51532 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.67■■■■□ 3.62
SMARCA4P51532 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC37.67■■■■□ 3.62
SMARCA4P51532 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.67■■■■□ 3.62
SMARCA4P51532 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC37.67■■■■□ 3.62
SMARCA4P51532 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.66■■■■□ 3.62
SMARCA4P51532 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC37.66■■■■□ 3.62
SMARCA4P51532 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.66■■■■□ 3.62
SMARCA4P51532 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.66■■■■□ 3.62
SMARCA4P51532 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC37.66■■■■□ 3.62
SMARCA4P51532 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC37.66■■■■□ 3.62
SMARCA4P51532 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC37.65■■■■□ 3.62
SMARCA4P51532 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.65■■■■□ 3.62
SMARCA4P51532 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC37.65■■■■□ 3.62
SMARCA4P51532 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.65■■■■□ 3.62
SMARCA4P51532 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC37.65■■■■□ 3.62
SMARCA4P51532 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC37.65■■■■□ 3.62
SMARCA4P51532 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC37.65■■■■□ 3.62
SMARCA4P51532 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.65■■■■□ 3.62
SMARCA4P51532 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.65■■■■□ 3.62
SMARCA4P51532 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC37.65■■■■□ 3.62
SMARCA4P51532 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC37.64■■■■□ 3.62
SMARCA4P51532 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.64■■■■□ 3.62
SMARCA4P51532 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC37.64■■■■□ 3.62
SMARCA4P51532 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.64■■■■□ 3.62
SMARCA4P51532 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.64■■■■□ 3.62
SMARCA4P51532 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.64■■■■□ 3.62
SMARCA4P51532 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC37.64■■■■□ 3.62
SMARCA4P51532 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.64■■■■□ 3.62
SMARCA4P51532 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC37.64■■■■□ 3.62
SMARCA4P51532 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.64■■■■□ 3.62
SMARCA4P51532 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.64■■■■□ 3.62
SMARCA4P51532 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC37.64■■■■□ 3.62
SMARCA4P51532 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.64■■■■□ 3.62
SMARCA4P51532 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC37.64■■■■□ 3.62
SMARCA4P51532 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.64■■■■□ 3.62
SMARCA4P51532 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC37.64■■■■□ 3.62
SMARCA4P51532 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.64■■■■□ 3.62
SMARCA4P51532 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.63■■■■□ 3.62
SMARCA4P51532 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.63■■■■□ 3.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms