Protein–RNA interactions for Protein: P50895

BCAM, Basal cell adhesion molecule, humanhuman

Predictions only

Length 628 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCAMP50895 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
BCAMP50895 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
BCAMP50895 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
BCAMP50895 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
BCAMP50895 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
BCAMP50895 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
BCAMP50895 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
BCAMP50895 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
BCAMP50895 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
BCAMP50895 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
BCAMP50895 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
BCAMP50895 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
BCAMP50895 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
BCAMP50895 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
BCAMP50895 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
BCAMP50895 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
BCAMP50895 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
BCAMP50895 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
BCAMP50895 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
BCAMP50895 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
BCAMP50895 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
BCAMP50895 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
BCAMP50895 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
BCAMP50895 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
BCAMP50895 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
BCAMP50895 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
BCAMP50895 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
BCAMP50895 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
BCAMP50895 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
BCAMP50895 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC25.3■■□□□ 1.64
BCAMP50895 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
BCAMP50895 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
BCAMP50895 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
BCAMP50895 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
BCAMP50895 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
BCAMP50895 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
BCAMP50895 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
BCAMP50895 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
BCAMP50895 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
BCAMP50895 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
BCAMP50895 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
BCAMP50895 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
BCAMP50895 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
BCAMP50895 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
BCAMP50895 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
BCAMP50895 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
BCAMP50895 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
BCAMP50895 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
BCAMP50895 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
BCAMP50895 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
BCAMP50895 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
BCAMP50895 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
BCAMP50895 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
BCAMP50895 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
BCAMP50895 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
BCAMP50895 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
BCAMP50895 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
BCAMP50895 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
BCAMP50895 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
BCAMP50895 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
BCAMP50895 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
BCAMP50895 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
BCAMP50895 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
BCAMP50895 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
BCAMP50895 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
BCAMP50895 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
BCAMP50895 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
BCAMP50895 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
BCAMP50895 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
BCAMP50895 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
BCAMP50895 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
BCAMP50895 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
BCAMP50895 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
BCAMP50895 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
BCAMP50895 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
BCAMP50895 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
BCAMP50895 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
BCAMP50895 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
BCAMP50895 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
BCAMP50895 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
BCAMP50895 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
BCAMP50895 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
BCAMP50895 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
BCAMP50895 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
BCAMP50895 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
BCAMP50895 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
BCAMP50895 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC25.26■■□□□ 1.63
BCAMP50895 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
BCAMP50895 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
BCAMP50895 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
BCAMP50895 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
BCAMP50895 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
BCAMP50895 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
BCAMP50895 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
BCAMP50895 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
BCAMP50895 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
BCAMP50895 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
BCAMP50895 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
BCAMP50895 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
BCAMP50895 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms