Protein–RNA interactions for Protein: P49662

CASP4, Caspase-4, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP4P49662 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CASP4P49662 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CASP4P49662 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CASP4P49662 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CASP4P49662 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CASP4P49662 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CASP4P49662 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CASP4P49662 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CASP4P49662 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CASP4P49662 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CASP4P49662 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CASP4P49662 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CASP4P49662 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CASP4P49662 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CASP4P49662 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CASP4P49662 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CASP4P49662 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CASP4P49662 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CASP4P49662 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CASP4P49662 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CASP4P49662 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CASP4P49662 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CASP4P49662 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CASP4P49662 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CASP4P49662 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CASP4P49662 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CASP4P49662 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CASP4P49662 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CASP4P49662 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CASP4P49662 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CASP4P49662 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CASP4P49662 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CASP4P49662 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CASP4P49662 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CASP4P49662 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CASP4P49662 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CASP4P49662 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CASP4P49662 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CASP4P49662 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CASP4P49662 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CASP4P49662 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CASP4P49662 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CASP4P49662 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CASP4P49662 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CASP4P49662 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CASP4P49662 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CASP4P49662 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CASP4P49662 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CASP4P49662 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CASP4P49662 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CASP4P49662 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CASP4P49662 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CASP4P49662 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CASP4P49662 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CASP4P49662 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CASP4P49662 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CASP4P49662 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CASP4P49662 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CASP4P49662 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CASP4P49662 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CASP4P49662 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CASP4P49662 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CASP4P49662 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CASP4P49662 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CASP4P49662 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CASP4P49662 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CASP4P49662 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CASP4P49662 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CASP4P49662 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CASP4P49662 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CASP4P49662 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CASP4P49662 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CASP4P49662 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CASP4P49662 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CASP4P49662 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CASP4P49662 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CASP4P49662 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CASP4P49662 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CASP4P49662 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CASP4P49662 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
CASP4P49662 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
CASP4P49662 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
CASP4P49662 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CASP4P49662 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CASP4P49662 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CASP4P49662 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CASP4P49662 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CASP4P49662 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CASP4P49662 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CASP4P49662 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CASP4P49662 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CASP4P49662 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CASP4P49662 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CASP4P49662 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CASP4P49662 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CASP4P49662 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CASP4P49662 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CASP4P49662 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CASP4P49662 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CASP4P49662 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms