Protein–RNA interactions for Protein: P48643

CCT5, T-complex protein 1 subunit epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCT5P48643 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCT5P48643 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCT5P48643 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCT5P48643 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCT5P48643 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCT5P48643 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCT5P48643 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCT5P48643 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCT5P48643 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCT5P48643 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCT5P48643 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCT5P48643 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCT5P48643 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCT5P48643 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCT5P48643 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCT5P48643 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
CCT5P48643 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCT5P48643 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCT5P48643 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCT5P48643 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCT5P48643 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCT5P48643 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCT5P48643 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCT5P48643 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCT5P48643 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCT5P48643 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCT5P48643 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
CCT5P48643 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCT5P48643 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCT5P48643 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCT5P48643 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCT5P48643 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCT5P48643 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCT5P48643 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCT5P48643 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCT5P48643 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCT5P48643 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCT5P48643 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCT5P48643 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCT5P48643 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCT5P48643 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCT5P48643 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCT5P48643 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCT5P48643 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCT5P48643 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCT5P48643 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCT5P48643 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCT5P48643 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCT5P48643 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCT5P48643 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCT5P48643 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCT5P48643 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCT5P48643 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCT5P48643 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCT5P48643 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCT5P48643 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCT5P48643 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCT5P48643 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCT5P48643 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCT5P48643 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCT5P48643 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCT5P48643 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCT5P48643 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCT5P48643 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCT5P48643 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCT5P48643 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCT5P48643 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCT5P48643 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCT5P48643 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCT5P48643 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCT5P48643 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCT5P48643 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCT5P48643 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCT5P48643 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCT5P48643 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCT5P48643 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCT5P48643 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCT5P48643 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCT5P48643 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCT5P48643 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.99
CCT5P48643 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.99
CCT5P48643 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
CCT5P48643 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
CCT5P48643 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCT5P48643 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCT5P48643 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCT5P48643 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
CCT5P48643 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCT5P48643 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCT5P48643 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCT5P48643 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCT5P48643 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCT5P48643 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCT5P48643 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCT5P48643 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCT5P48643 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCT5P48643 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCT5P48643 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCT5P48643 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCT5P48643 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.9 ms