Protein–RNA interactions for Protein: P46934

NEDD4, E3 ubiquitin-protein ligase NEDD4, humanhuman

Predictions only

Length 1,319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD4P46934 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
NEDD4P46934 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NEDD4P46934 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NEDD4P46934 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NEDD4P46934 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
NEDD4P46934 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NEDD4P46934 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NEDD4P46934 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NEDD4P46934 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
NEDD4P46934 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NEDD4P46934 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
NEDD4P46934 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NEDD4P46934 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NEDD4P46934 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
NEDD4P46934 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NEDD4P46934 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
NEDD4P46934 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC24.58■■□□□ 1.52
NEDD4P46934 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
NEDD4P46934 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
NEDD4P46934 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
NEDD4P46934 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC24.58■■□□□ 1.52
NEDD4P46934 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
NEDD4P46934 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NEDD4P46934 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NEDD4P46934 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NEDD4P46934 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NEDD4P46934 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NEDD4P46934 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NEDD4P46934 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NEDD4P46934 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NEDD4P46934 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
NEDD4P46934 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NEDD4P46934 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NEDD4P46934 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
NEDD4P46934 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
NEDD4P46934 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
NEDD4P46934 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NEDD4P46934 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
NEDD4P46934 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NEDD4P46934 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NEDD4P46934 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
NEDD4P46934 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NEDD4P46934 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
NEDD4P46934 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NEDD4P46934 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NEDD4P46934 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
NEDD4P46934 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
NEDD4P46934 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
NEDD4P46934 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
NEDD4P46934 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
NEDD4P46934 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NEDD4P46934 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
NEDD4P46934 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
NEDD4P46934 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NEDD4P46934 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NEDD4P46934 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NEDD4P46934 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NEDD4P46934 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NEDD4P46934 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NEDD4P46934 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
NEDD4P46934 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NEDD4P46934 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NEDD4P46934 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NEDD4P46934 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NEDD4P46934 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NEDD4P46934 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
NEDD4P46934 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NEDD4P46934 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NEDD4P46934 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NEDD4P46934 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NEDD4P46934 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NEDD4P46934 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NEDD4P46934 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NEDD4P46934 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
NEDD4P46934 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NEDD4P46934 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NEDD4P46934 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NEDD4P46934 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NEDD4P46934 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NEDD4P46934 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NEDD4P46934 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NEDD4P46934 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
NEDD4P46934 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NEDD4P46934 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NEDD4P46934 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NEDD4P46934 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NEDD4P46934 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NEDD4P46934 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NEDD4P46934 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NEDD4P46934 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NEDD4P46934 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NEDD4P46934 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NEDD4P46934 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NEDD4P46934 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NEDD4P46934 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NEDD4P46934 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
NEDD4P46934 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NEDD4P46934 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NEDD4P46934 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NEDD4P46934 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms