Protein–RNA interactions for Protein: P43115

PTGER3, Prostaglandin E2 receptor EP3 subtype, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGER3P43115 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PTGER3P43115 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
PTGER3P43115 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PTGER3P43115 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PTGER3P43115 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PTGER3P43115 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PTGER3P43115 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
PTGER3P43115 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PTGER3P43115 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PTGER3P43115 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PTGER3P43115 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PTGER3P43115 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PTGER3P43115 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PTGER3P43115 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PTGER3P43115 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
PTGER3P43115 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PTGER3P43115 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PTGER3P43115 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PTGER3P43115 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PTGER3P43115 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PTGER3P43115 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PTGER3P43115 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
PTGER3P43115 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
PTGER3P43115 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
PTGER3P43115 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.98
PTGER3P43115 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PTGER3P43115 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PTGER3P43115 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PTGER3P43115 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PTGER3P43115 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PTGER3P43115 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PTGER3P43115 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
PTGER3P43115 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
PTGER3P43115 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PTGER3P43115 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PTGER3P43115 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PTGER3P43115 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PTGER3P43115 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PTGER3P43115 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PTGER3P43115 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PTGER3P43115 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PTGER3P43115 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PTGER3P43115 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PTGER3P43115 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PTGER3P43115 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
PTGER3P43115 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PTGER3P43115 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PTGER3P43115 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PTGER3P43115 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PTGER3P43115 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PTGER3P43115 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PTGER3P43115 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PTGER3P43115 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PTGER3P43115 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PTGER3P43115 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PTGER3P43115 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PTGER3P43115 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PTGER3P43115 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PTGER3P43115 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PTGER3P43115 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PTGER3P43115 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
PTGER3P43115 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PTGER3P43115 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PTGER3P43115 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PTGER3P43115 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PTGER3P43115 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PTGER3P43115 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PTGER3P43115 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PTGER3P43115 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PTGER3P43115 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PTGER3P43115 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PTGER3P43115 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PTGER3P43115 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PTGER3P43115 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PTGER3P43115 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PTGER3P43115 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PTGER3P43115 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PTGER3P43115 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PTGER3P43115 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PTGER3P43115 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PTGER3P43115 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PTGER3P43115 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PTGER3P43115 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PTGER3P43115 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PTGER3P43115 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PTGER3P43115 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PTGER3P43115 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PTGER3P43115 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PTGER3P43115 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
PTGER3P43115 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PTGER3P43115 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PTGER3P43115 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
PTGER3P43115 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PTGER3P43115 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PTGER3P43115 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PTGER3P43115 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PTGER3P43115 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PTGER3P43115 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PTGER3P43115 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PTGER3P43115 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms