Protein–RNA interactions for Protein: P42765

ACAA2, 3-ketoacyl-CoA thiolase, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 397 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACAA2P42765 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
ACAA2P42765 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ACAA2P42765 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ACAA2P42765 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ACAA2P42765 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ACAA2P42765 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ACAA2P42765 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ACAA2P42765 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ACAA2P42765 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ACAA2P42765 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ACAA2P42765 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ACAA2P42765 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ACAA2P42765 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ACAA2P42765 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ACAA2P42765 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ACAA2P42765 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ACAA2P42765 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ACAA2P42765 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ACAA2P42765 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ACAA2P42765 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ACAA2P42765 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ACAA2P42765 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ACAA2P42765 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
ACAA2P42765 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
ACAA2P42765 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ACAA2P42765 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ACAA2P42765 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ACAA2P42765 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ACAA2P42765 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ACAA2P42765 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ACAA2P42765 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ACAA2P42765 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ACAA2P42765 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ACAA2P42765 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ACAA2P42765 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ACAA2P42765 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ACAA2P42765 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ACAA2P42765 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ACAA2P42765 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ACAA2P42765 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ACAA2P42765 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
ACAA2P42765 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ACAA2P42765 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ACAA2P42765 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
ACAA2P42765 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ACAA2P42765 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ACAA2P42765 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ACAA2P42765 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ACAA2P42765 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ACAA2P42765 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ACAA2P42765 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ACAA2P42765 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ACAA2P42765 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ACAA2P42765 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ACAA2P42765 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ACAA2P42765 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ACAA2P42765 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ACAA2P42765 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ACAA2P42765 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ACAA2P42765 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ACAA2P42765 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ACAA2P42765 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ACAA2P42765 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ACAA2P42765 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ACAA2P42765 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ACAA2P42765 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ACAA2P42765 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ACAA2P42765 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ACAA2P42765 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ACAA2P42765 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ACAA2P42765 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ACAA2P42765 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ACAA2P42765 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ACAA2P42765 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ACAA2P42765 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ACAA2P42765 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ACAA2P42765 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ACAA2P42765 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ACAA2P42765 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ACAA2P42765 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ACAA2P42765 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ACAA2P42765 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ACAA2P42765 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ACAA2P42765 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ACAA2P42765 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ACAA2P42765 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ACAA2P42765 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ACAA2P42765 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ACAA2P42765 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ACAA2P42765 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ACAA2P42765 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ACAA2P42765 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ACAA2P42765 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ACAA2P42765 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ACAA2P42765 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
ACAA2P42765 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ACAA2P42765 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ACAA2P42765 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ACAA2P42765 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ACAA2P42765 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms