Protein–RNA interactions for Protein: P42262

GRIA2, Glutamate receptor 2, humanhuman

Predictions only

Length 883 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIA2P42262 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GRIA2P42262 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GRIA2P42262 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GRIA2P42262 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GRIA2P42262 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
GRIA2P42262 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GRIA2P42262 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GRIA2P42262 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GRIA2P42262 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GRIA2P42262 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GRIA2P42262 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GRIA2P42262 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GRIA2P42262 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GRIA2P42262 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GRIA2P42262 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GRIA2P42262 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GRIA2P42262 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GRIA2P42262 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GRIA2P42262 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GRIA2P42262 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GRIA2P42262 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GRIA2P42262 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GRIA2P42262 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GRIA2P42262 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
GRIA2P42262 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GRIA2P42262 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GRIA2P42262 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GRIA2P42262 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GRIA2P42262 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GRIA2P42262 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GRIA2P42262 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GRIA2P42262 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GRIA2P42262 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GRIA2P42262 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GRIA2P42262 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
GRIA2P42262 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GRIA2P42262 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GRIA2P42262 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GRIA2P42262 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GRIA2P42262 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GRIA2P42262 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GRIA2P42262 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GRIA2P42262 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GRIA2P42262 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GRIA2P42262 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GRIA2P42262 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GRIA2P42262 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GRIA2P42262 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GRIA2P42262 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GRIA2P42262 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GRIA2P42262 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GRIA2P42262 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GRIA2P42262 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GRIA2P42262 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GRIA2P42262 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GRIA2P42262 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GRIA2P42262 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GRIA2P42262 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GRIA2P42262 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GRIA2P42262 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
GRIA2P42262 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
GRIA2P42262 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
GRIA2P42262 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GRIA2P42262 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GRIA2P42262 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GRIA2P42262 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GRIA2P42262 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GRIA2P42262 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GRIA2P42262 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GRIA2P42262 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GRIA2P42262 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GRIA2P42262 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GRIA2P42262 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GRIA2P42262 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GRIA2P42262 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GRIA2P42262 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GRIA2P42262 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GRIA2P42262 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GRIA2P42262 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GRIA2P42262 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GRIA2P42262 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GRIA2P42262 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GRIA2P42262 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GRIA2P42262 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
GRIA2P42262 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
GRIA2P42262 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GRIA2P42262 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GRIA2P42262 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GRIA2P42262 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GRIA2P42262 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GRIA2P42262 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GRIA2P42262 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GRIA2P42262 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GRIA2P42262 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GRIA2P42262 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GRIA2P42262 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
GRIA2P42262 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GRIA2P42262 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GRIA2P42262 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GRIA2P42262 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms