Protein–RNA interactions for Protein: P41273

TNFSF9, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 9, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFSF9P41273 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TNFSF9P41273 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
TNFSF9P41273 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TNFSF9P41273 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TNFSF9P41273 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TNFSF9P41273 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TNFSF9P41273 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TNFSF9P41273 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TNFSF9P41273 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TNFSF9P41273 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TNFSF9P41273 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TNFSF9P41273 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TNFSF9P41273 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TNFSF9P41273 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TNFSF9P41273 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TNFSF9P41273 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TNFSF9P41273 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TNFSF9P41273 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TNFSF9P41273 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
TNFSF9P41273 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
TNFSF9P41273 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
TNFSF9P41273 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
TNFSF9P41273 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TNFSF9P41273 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TNFSF9P41273 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TNFSF9P41273 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TNFSF9P41273 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TNFSF9P41273 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TNFSF9P41273 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
TNFSF9P41273 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TNFSF9P41273 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TNFSF9P41273 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TNFSF9P41273 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TNFSF9P41273 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TNFSF9P41273 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TNFSF9P41273 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TNFSF9P41273 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TNFSF9P41273 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TNFSF9P41273 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TNFSF9P41273 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TNFSF9P41273 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TNFSF9P41273 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TNFSF9P41273 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TNFSF9P41273 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TNFSF9P41273 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TNFSF9P41273 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TNFSF9P41273 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
TNFSF9P41273 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TNFSF9P41273 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
TNFSF9P41273 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TNFSF9P41273 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TNFSF9P41273 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TNFSF9P41273 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TNFSF9P41273 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TNFSF9P41273 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TNFSF9P41273 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TNFSF9P41273 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TNFSF9P41273 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TNFSF9P41273 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TNFSF9P41273 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TNFSF9P41273 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TNFSF9P41273 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TNFSF9P41273 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TNFSF9P41273 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
TNFSF9P41273 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TNFSF9P41273 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TNFSF9P41273 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TNFSF9P41273 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
TNFSF9P41273 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TNFSF9P41273 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TNFSF9P41273 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TNFSF9P41273 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TNFSF9P41273 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TNFSF9P41273 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TNFSF9P41273 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TNFSF9P41273 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TNFSF9P41273 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TNFSF9P41273 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TNFSF9P41273 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TNFSF9P41273 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TNFSF9P41273 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
TNFSF9P41273 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
TNFSF9P41273 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TNFSF9P41273 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TNFSF9P41273 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TNFSF9P41273 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TNFSF9P41273 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TNFSF9P41273 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TNFSF9P41273 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TNFSF9P41273 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TNFSF9P41273 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TNFSF9P41273 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TNFSF9P41273 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TNFSF9P41273 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
TNFSF9P41273 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
TNFSF9P41273 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TNFSF9P41273 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
TNFSF9P41273 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TNFSF9P41273 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TNFSF9P41273 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.5 ms