Protein–RNA interactions for Protein: P40486

SHQ1, Protein SHQ1, yeastyeast

Predicted RBP Predictions only

Length 507 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SHQ1P40486 YMR046CYMR046C 1323 nt2.5□□□□□ -2.01
SHQ1P40486 YNL284C-AYNL284C-A 1323 nt2.5□□□□□ -2.01
SHQ1P40486 BUD26YDR241W 288 nt2.5□□□□□ -2.01
SHQ1P40486 SEC4YFL005W 648 nt2.5□□□□□ -2.01
SHQ1P40486 RSR1YGR152C 819 nt2.5□□□□□ -2.01
SHQ1P40486 VMA10YHR039C-A 345 nt2.5□□□□□ -2.01
SHQ1P40486 DSE2YHR143W 978 nt2.5□□□□□ -2.01
SHQ1P40486 YHR212CYHR212C 336 nt2.5□□□□□ -2.01
SHQ1P40486 AYR1YIL124W 894 nt2.5□□□□□ -2.01
SHQ1P40486 YAR060CYAR060C 336 nt2.5□□□□□ -2.01
SHQ1P40486 YML094C-AYML094C-A 402 nt2.5□□□□□ -2.01
SHQ1P40486 YBL055CYBL055C 1257 nt2.5□□□□□ -2.01
SHQ1P40486 YNL276CYNL276C 396 nt2.5□□□□□ -2.01
SHQ1P40486 UFE1YOR075W 1041 nt2.5□□□□□ -2.01
SHQ1P40486 YBR013CYBR013C 390 nt2.5□□□□□ -2.01
SHQ1P40486 HOP1YIL072W 1818 nt2.49□□□□□ -2.01
SHQ1P40486 SMC6YLR383W 3345 nt2.49□□□□□ -2.01
SHQ1P40486 HLR1YDR528W 1272 nt2.49□□□□□ -2.01
SHQ1P40486 COG7YGL005C 840 nt2.49□□□□□ -2.01
SHQ1P40486 GET1YGL020C 708 nt2.49□□□□□ -2.01
SHQ1P40486 YGR270C-AYGR270C-A 219 nt2.49□□□□□ -2.01
SHQ1P40486 YHR022CYHR022C 771 nt2.49□□□□□ -2.01
SHQ1P40486 YAL037WYAL037W 804 nt2.49□□□□□ -2.01
SHQ1P40486 PSY1YKL076C 384 nt2.49□□□□□ -2.01
SHQ1P40486 ATG19YOL082W 1248 nt2.49□□□□□ -2.01
SHQ1P40486 SGT1YOR057W 1188 nt2.49□□□□□ -2.01
SHQ1P40486 PIS1YPR113W 663 nt2.49□□□□□ -2.01
SHQ1P40486 ANR2YKL047W 1551 nt2.49□□□□□ -2.01
SHQ1P40486 SAK1YER129W 3429 nt2.48□□□□□ -2.01
SHQ1P40486 TRM82YDR165W 1335 nt2.48□□□□□ -2.01
SHQ1P40486 ORC2YBR060C 1863 nt2.48□□□□□ -2.01
SHQ1P40486 APL5YPL195W 2799 nt2.48□□□□□ -2.01
SHQ1P40486 MDM10YAL010C 1482 nt2.48□□□□□ -2.01
SHQ1P40486 SIR3YLR442C 2937 nt2.48□□□□□ -2.01
SHQ1P40486 NRG1YDR043C 696 nt2.48□□□□□ -2.01
SHQ1P40486 TIM11YDR322C-A 291 nt2.48□□□□□ -2.01
SHQ1P40486 YGR293CYGR293C 462 nt2.48□□□□□ -2.01
SHQ1P40486 SRL3YKR091W 741 nt2.48□□□□□ -2.01
SHQ1P40486 RPS29AYLR388W 171 nt2.48□□□□□ -2.01
SHQ1P40486 MTG1YMR097C 1104 nt2.48□□□□□ -2.01
SHQ1P40486 YMR187CYMR187C 1296 nt2.48□□□□□ -2.01
SHQ1P40486 YOL134CYOL134C 390 nt2.48□□□□□ -2.01
SHQ1P40486 FAR11YNL127W 2862 nt2.48□□□□□ -2.01
SHQ1P40486 YBT1YLL048C 4986 nt2.48□□□□□ -2.01
SHQ1P40486 PSD2YGR170W 3417 nt2.48□□□□□ -2.01
SHQ1P40486 NOP56YLR197W 1515 nt2.47□□□□□ -2.01
SHQ1P40486 PDS5YMR076C 3834 nt2.47□□□□□ -2.01
SHQ1P40486 YOL098CYOL098C 3114 nt2.47□□□□□ -2.01
SHQ1P40486 TFB1YDR311W 1929 nt2.47□□□□□ -2.01
SHQ1P40486 ERG28YER044C 447 nt2.47□□□□□ -2.01
SHQ1P40486 PEA2YER149C 1263 nt2.47□□□□□ -2.01
SHQ1P40486 YGL204CYGL204C 306 nt2.47□□□□□ -2.01
SHQ1P40486 OTU2YHL013C 924 nt2.47□□□□□ -2.01
SHQ1P40486 YJL114WYJL114W 681 nt2.47□□□□□ -2.01
SHQ1P40486 SFT1YKL006C-A 294 nt2.47□□□□□ -2.01
SHQ1P40486 YKL131WYKL131W 522 nt2.47□□□□□ -2.01
SHQ1P40486 CCW14YLR390W-A 717 nt2.47□□□□□ -2.01
SHQ1P40486 RPS1AYLR441C 768 nt2.47□□□□□ -2.01
SHQ1P40486 ARF3YOR094W 552 nt2.47□□□□□ -2.01
SHQ1P40486 TMA64YDR117C 1698 nt2.47□□□□□ -2.01
SHQ1P40486 TFC3YAL001C 3483 nt2.47□□□□□ -2.01
SHQ1P40486 STH1YIL126W 4080 nt2.47□□□□□ -2.01
SHQ1P40486 BIT61YJL058C 1632 nt2.46□□□□□ -2.02
SHQ1P40486 CPR5YDR304C 678 nt2.46□□□□□ -2.02
SHQ1P40486 EMI1YDR512C 564 nt2.46□□□□□ -2.02
SHQ1P40486 YIL068W-AYIL068W-A 384 nt2.46□□□□□ -2.02
SHQ1P40486 YIL141WYIL141W 390 nt2.46□□□□□ -2.02
SHQ1P40486 MRPS8YMR158W 468 nt2.46□□□□□ -2.02
SHQ1P40486 MER1YNL210W 813 nt2.46□□□□□ -2.02
SHQ1P40486 PEX17YNL214W 600 nt2.46□□□□□ -2.02
SHQ1P40486 COQ10YOL008W 624 nt2.46□□□□□ -2.02
SHQ1P40486 RFC5YBR087W 1065 nt2.46□□□□□ -2.02
SHQ1P40486 PHO2YDL106C 1680 nt2.46□□□□□ -2.02
SHQ1P40486 KRE33YNL132W 3171 nt2.45□□□□□ -2.02
SHQ1P40486 AEP1YMR064W 1557 nt2.45□□□□□ -2.02
SHQ1P40486 IRC8YJL051W 2469 nt2.45□□□□□ -2.02
SHQ1P40486 VTC1YER072W 390 nt2.45□□□□□ -2.02
SHQ1P40486 YER138W-AYER138W-A 105 nt2.45□□□□□ -2.02
SHQ1P40486 VEL1YGL258W 621 nt2.45□□□□□ -2.02
SHQ1P40486 YHR052W-AYHR052W-A 195 nt2.45□□□□□ -2.02
SHQ1P40486 YHR054W-AYHR054W-A 195 nt2.45□□□□□ -2.02
SHQ1P40486 LSM12YHR121W 564 nt2.45□□□□□ -2.02
SHQ1P40486 YKR070WYKR070W 1059 nt2.45□□□□□ -2.02
SHQ1P40486 CWC24YLR323C 780 nt2.45□□□□□ -2.02
SHQ1P40486 YIP3YNL044W 531 nt2.45□□□□□ -2.02
SHQ1P40486 MRPL17YNL252C 846 nt2.45□□□□□ -2.02
SHQ1P40486 YBL107W-AYBL107W-A 105 nt2.45□□□□□ -2.02
SHQ1P40486 YOL107WYOL107W 1029 nt2.45□□□□□ -2.02
SHQ1P40486 NEL1YHR035W 1893 nt2.45□□□□□ -2.02
SHQ1P40486 KAR1YNL188W 1302 nt2.44□□□□□ -2.02
SHQ1P40486 PIG2YIL045W 1617 nt2.44□□□□□ -2.02
SHQ1P40486 SHR3YDL212W 633 nt2.44□□□□□ -2.02
SHQ1P40486 TVP15YDR100W 432 nt2.44□□□□□ -2.02
SHQ1P40486 GIC2YDR309C 1152 nt2.44□□□□□ -2.02
SHQ1P40486 YGL117WYGL117W 798 nt2.44□□□□□ -2.02
SHQ1P40486 YGL242CYGL242C 546 nt2.44□□□□□ -2.02
SHQ1P40486 VAM3YOR106W 852 nt2.44□□□□□ -2.02
SHQ1P40486 ATP3YBR039W 936 nt2.44□□□□□ -2.02
SHQ1P40486 CLN3YAL040C 1743 nt2.44□□□□□ -2.02
SHQ1P40486 YJL049WYJL049W 1353 nt2.44□□□□□ -2.02
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