Protein–RNA interactions for Protein: P38935

IGHMBP2, DNA-binding protein SMUBP-2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 993 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGHMBP2P38935 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
IGHMBP2P38935 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
IGHMBP2P38935 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
IGHMBP2P38935 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
IGHMBP2P38935 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
IGHMBP2P38935 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
IGHMBP2P38935 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
IGHMBP2P38935 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
IGHMBP2P38935 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
IGHMBP2P38935 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
IGHMBP2P38935 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
IGHMBP2P38935 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
IGHMBP2P38935 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
IGHMBP2P38935 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
IGHMBP2P38935 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
IGHMBP2P38935 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
IGHMBP2P38935 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
IGHMBP2P38935 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
IGHMBP2P38935 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
IGHMBP2P38935 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
IGHMBP2P38935 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.7
IGHMBP2P38935 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
IGHMBP2P38935 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC25.64■■□□□ 1.7
IGHMBP2P38935 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.64■■□□□ 1.7
IGHMBP2P38935 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
IGHMBP2P38935 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
IGHMBP2P38935 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
IGHMBP2P38935 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
IGHMBP2P38935 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
IGHMBP2P38935 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
IGHMBP2P38935 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
IGHMBP2P38935 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
IGHMBP2P38935 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
IGHMBP2P38935 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
IGHMBP2P38935 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
IGHMBP2P38935 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
IGHMBP2P38935 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
IGHMBP2P38935 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
IGHMBP2P38935 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
IGHMBP2P38935 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
IGHMBP2P38935 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
IGHMBP2P38935 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
IGHMBP2P38935 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
IGHMBP2P38935 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
IGHMBP2P38935 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
IGHMBP2P38935 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
IGHMBP2P38935 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
IGHMBP2P38935 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
IGHMBP2P38935 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
IGHMBP2P38935 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
IGHMBP2P38935 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
IGHMBP2P38935 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
IGHMBP2P38935 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
IGHMBP2P38935 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
IGHMBP2P38935 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
IGHMBP2P38935 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
IGHMBP2P38935 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
IGHMBP2P38935 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
IGHMBP2P38935 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
IGHMBP2P38935 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
IGHMBP2P38935 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
IGHMBP2P38935 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
IGHMBP2P38935 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
IGHMBP2P38935 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
IGHMBP2P38935 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
IGHMBP2P38935 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
IGHMBP2P38935 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
IGHMBP2P38935 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
IGHMBP2P38935 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
IGHMBP2P38935 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
IGHMBP2P38935 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
IGHMBP2P38935 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
IGHMBP2P38935 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
IGHMBP2P38935 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
IGHMBP2P38935 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
IGHMBP2P38935 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
IGHMBP2P38935 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
IGHMBP2P38935 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
IGHMBP2P38935 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
IGHMBP2P38935 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
IGHMBP2P38935 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
IGHMBP2P38935 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
IGHMBP2P38935 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
IGHMBP2P38935 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
IGHMBP2P38935 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
IGHMBP2P38935 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
IGHMBP2P38935 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
IGHMBP2P38935 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
IGHMBP2P38935 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
IGHMBP2P38935 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
IGHMBP2P38935 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
IGHMBP2P38935 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
IGHMBP2P38935 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
IGHMBP2P38935 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
IGHMBP2P38935 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
IGHMBP2P38935 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
IGHMBP2P38935 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
IGHMBP2P38935 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
IGHMBP2P38935 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
IGHMBP2P38935 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.8 ms