Protein–RNA interactions for Protein: P36954

POLR2I, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB9, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2IP36954 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
POLR2IP36954 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
POLR2IP36954 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
POLR2IP36954 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
POLR2IP36954 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
POLR2IP36954 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
POLR2IP36954 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
POLR2IP36954 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
POLR2IP36954 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
POLR2IP36954 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
POLR2IP36954 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
POLR2IP36954 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
POLR2IP36954 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
POLR2IP36954 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
POLR2IP36954 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
POLR2IP36954 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
POLR2IP36954 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
POLR2IP36954 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
POLR2IP36954 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
POLR2IP36954 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
POLR2IP36954 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
POLR2IP36954 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
POLR2IP36954 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
POLR2IP36954 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
POLR2IP36954 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
POLR2IP36954 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
POLR2IP36954 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
POLR2IP36954 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
POLR2IP36954 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
POLR2IP36954 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
POLR2IP36954 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
POLR2IP36954 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
POLR2IP36954 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
POLR2IP36954 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
POLR2IP36954 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
POLR2IP36954 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
POLR2IP36954 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
POLR2IP36954 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
POLR2IP36954 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
POLR2IP36954 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
POLR2IP36954 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
POLR2IP36954 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
POLR2IP36954 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
POLR2IP36954 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
POLR2IP36954 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
POLR2IP36954 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
POLR2IP36954 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
POLR2IP36954 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
POLR2IP36954 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
POLR2IP36954 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
POLR2IP36954 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
POLR2IP36954 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
POLR2IP36954 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
POLR2IP36954 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
POLR2IP36954 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
POLR2IP36954 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
POLR2IP36954 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
POLR2IP36954 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
POLR2IP36954 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
POLR2IP36954 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
POLR2IP36954 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
POLR2IP36954 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
POLR2IP36954 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
POLR2IP36954 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
POLR2IP36954 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
POLR2IP36954 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
POLR2IP36954 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
POLR2IP36954 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
POLR2IP36954 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
POLR2IP36954 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
POLR2IP36954 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
POLR2IP36954 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
POLR2IP36954 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
POLR2IP36954 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
POLR2IP36954 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
POLR2IP36954 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
POLR2IP36954 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
POLR2IP36954 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
POLR2IP36954 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
POLR2IP36954 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
POLR2IP36954 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
POLR2IP36954 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
POLR2IP36954 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
POLR2IP36954 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
POLR2IP36954 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
POLR2IP36954 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
POLR2IP36954 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
POLR2IP36954 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
POLR2IP36954 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
POLR2IP36954 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
POLR2IP36954 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
POLR2IP36954 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
POLR2IP36954 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
POLR2IP36954 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
POLR2IP36954 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
POLR2IP36954 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC19.08■□□□□ 0.64
POLR2IP36954 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
POLR2IP36954 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
POLR2IP36954 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
POLR2IP36954 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms