Protein–RNA interactions for Protein: P36544

CHRNA7, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-7, humanhuman

Predictions only

Length 502 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA7P36544 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CHRNA7P36544 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CHRNA7P36544 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CHRNA7P36544 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CHRNA7P36544 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CHRNA7P36544 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CHRNA7P36544 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CHRNA7P36544 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CHRNA7P36544 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CHRNA7P36544 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CHRNA7P36544 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CHRNA7P36544 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CHRNA7P36544 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CHRNA7P36544 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CHRNA7P36544 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CHRNA7P36544 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CHRNA7P36544 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CHRNA7P36544 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CHRNA7P36544 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
CHRNA7P36544 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CHRNA7P36544 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CHRNA7P36544 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CHRNA7P36544 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CHRNA7P36544 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.3
CHRNA7P36544 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
CHRNA7P36544 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
CHRNA7P36544 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CHRNA7P36544 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CHRNA7P36544 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CHRNA7P36544 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CHRNA7P36544 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CHRNA7P36544 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CHRNA7P36544 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CHRNA7P36544 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
CHRNA7P36544 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CHRNA7P36544 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CHRNA7P36544 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CHRNA7P36544 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CHRNA7P36544 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CHRNA7P36544 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CHRNA7P36544 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CHRNA7P36544 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CHRNA7P36544 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CHRNA7P36544 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CHRNA7P36544 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CHRNA7P36544 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CHRNA7P36544 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CHRNA7P36544 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CHRNA7P36544 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
CHRNA7P36544 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CHRNA7P36544 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CHRNA7P36544 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CHRNA7P36544 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CHRNA7P36544 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CHRNA7P36544 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CHRNA7P36544 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CHRNA7P36544 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CHRNA7P36544 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CHRNA7P36544 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
CHRNA7P36544 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CHRNA7P36544 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CHRNA7P36544 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CHRNA7P36544 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CHRNA7P36544 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CHRNA7P36544 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CHRNA7P36544 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CHRNA7P36544 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CHRNA7P36544 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CHRNA7P36544 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
CHRNA7P36544 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CHRNA7P36544 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CHRNA7P36544 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CHRNA7P36544 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CHRNA7P36544 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CHRNA7P36544 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CHRNA7P36544 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CHRNA7P36544 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CHRNA7P36544 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CHRNA7P36544 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CHRNA7P36544 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CHRNA7P36544 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CHRNA7P36544 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CHRNA7P36544 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CHRNA7P36544 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CHRNA7P36544 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CHRNA7P36544 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CHRNA7P36544 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CHRNA7P36544 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CHRNA7P36544 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CHRNA7P36544 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CHRNA7P36544 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CHRNA7P36544 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CHRNA7P36544 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CHRNA7P36544 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CHRNA7P36544 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CHRNA7P36544 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
CHRNA7P36544 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CHRNA7P36544 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CHRNA7P36544 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CHRNA7P36544 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms