Protein–RNA interactions for Protein: P32926

DSG3, Desmoglein-3, humanhuman

Predictions only

Length 999 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSG3P32926 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
DSG3P32926 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
DSG3P32926 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
DSG3P32926 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
DSG3P32926 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
DSG3P32926 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
DSG3P32926 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
DSG3P32926 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
DSG3P32926 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
DSG3P32926 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
DSG3P32926 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
DSG3P32926 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
DSG3P32926 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
DSG3P32926 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
DSG3P32926 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
DSG3P32926 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
DSG3P32926 SEC63P1-201ENST00000425785 1258 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
DSG3P32926 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
DSG3P32926 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
DSG3P32926 AC090142.2-201ENST00000483263 416 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
DSG3P32926 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
DSG3P32926 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
DSG3P32926 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
DSG3P32926 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
DSG3P32926 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
DSG3P32926 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
DSG3P32926 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
DSG3P32926 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
DSG3P32926 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
DSG3P32926 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
DSG3P32926 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
DSG3P32926 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC24■■□□□ 1.43
DSG3P32926 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
DSG3P32926 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC24■■□□□ 1.43
DSG3P32926 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
DSG3P32926 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
DSG3P32926 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
DSG3P32926 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
DSG3P32926 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
DSG3P32926 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
DSG3P32926 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
DSG3P32926 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
DSG3P32926 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
DSG3P32926 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
DSG3P32926 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
DSG3P32926 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
DSG3P32926 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
DSG3P32926 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
DSG3P32926 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
DSG3P32926 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
DSG3P32926 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
DSG3P32926 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
DSG3P32926 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
DSG3P32926 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
DSG3P32926 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
DSG3P32926 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
DSG3P32926 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
DSG3P32926 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
DSG3P32926 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
DSG3P32926 AL365223.1-201ENST00000574864 1297 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
DSG3P32926 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
DSG3P32926 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
DSG3P32926 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
DSG3P32926 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
DSG3P32926 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
DSG3P32926 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
DSG3P32926 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
DSG3P32926 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
DSG3P32926 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
DSG3P32926 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
DSG3P32926 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
DSG3P32926 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
DSG3P32926 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
DSG3P32926 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
DSG3P32926 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
DSG3P32926 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
DSG3P32926 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
DSG3P32926 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
DSG3P32926 AC091489.1-201ENST00000563866 691 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
DSG3P32926 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
DSG3P32926 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
DSG3P32926 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
DSG3P32926 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
DSG3P32926 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
DSG3P32926 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
DSG3P32926 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
DSG3P32926 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
DSG3P32926 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
DSG3P32926 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
DSG3P32926 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
DSG3P32926 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
DSG3P32926 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
DSG3P32926 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
DSG3P32926 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
DSG3P32926 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
DSG3P32926 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
DSG3P32926 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
DSG3P32926 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
DSG3P32926 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
DSG3P32926 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms