Protein–RNA interactions for Protein: P32578

SIP1, SNF1 protein kinase subunit beta-1, yeast

Predictions only

Length 815 aa.

Protein		RNA				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	UniProt Accession	Gene	Ensembl Transcript ID	Length	Transcript Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SIP1	P32578	HHF2	YNL030W	312 nt		3.19	□□□□□ -1.9
SIP1	P32578	YOR169C	YOR169C	465 nt		3.19	□□□□□ -1.9
SIP1	P32578	MRPL40	YPL173W	894 nt		3.19	□□□□□ -1.9
SIP1	P32578	YPR050C	YPR050C	414 nt		3.19	□□□□□ -1.9
SIP1	P32578	MPS1	YDL028C	2295 nt		3.18	□□□□□ -1.9
SIP1	P32578	MUS81	YDR386W	1899 nt		3.18	□□□□□ -1.9
SIP1	P32578	VPS30	YPL120W	1674 nt		3.18	□□□□□ -1.9
SIP1	P32578	SEC15	YGL233W	2733 nt		3.18	□□□□□ -1.9
SIP1	P32578	ARO1	YDR127W	4767 nt		3.18	□□□□□ -1.9
SIP1	P32578	YDL009C	YDL009C	324 nt		3.18	□□□□□ -1.9
SIP1	P32578	YDR157W	YDR157W	402 nt		3.18	□□□□□ -1.9
SIP1	P32578	YDR442W	YDR442W	393 nt		3.18	□□□□□ -1.9
SIP1	P32578	YER119C-A	YER119C-A	372 nt		3.18	□□□□□ -1.9
SIP1	P32578	SPO13	YHR014W	876 nt		3.18	□□□□□ -1.9
SIP1	P32578	YKL063C	YKL063C	504 nt		3.18	□□□□□ -1.9
SIP1	P32578	RED1	YLR263W	2484 nt		3.18	□□□□□ -1.9
SIP1	P32578	SMC3	YJL074C	3693 nt		3.18	□□□□□ -1.9
SIP1	P32578	YDR338C	YDR338C	2088 nt		3.18	□□□□□ -1.9
SIP1	P32578	DBF20	YPR111W	1695 nt		3.17	□□□□□ -1.9
SIP1	P32578	YDL176W	YDL176W	2127 nt		3.17	□□□□□ -1.9
SIP1	P32578	SPO23	YBR250W	1572 nt		3.17	□□□□□ -1.9
SIP1	P32578	CBS1	YDL069C	690 nt		3.17	□□□□□ -1.9
SIP1	P32578	YDR114C	YDR114C	303 nt		3.17	□□□□□ -1.9
SIP1	P32578	YAL064W-B	YAL064W-B	381 nt		3.17	□□□□□ -1.9
SIP1	P32578	SRL3	YKR091W	741 nt		3.17	□□□□□ -1.9
SIP1	P32578	YML116W-A	YML116W-A	303 nt		3.17	□□□□□ -1.9
SIP1	P32578	YMR052C-A	YMR052C-A	366 nt		3.17	□□□□□ -1.9
SIP1	P32578	RHO5	YNL180C	996 nt		3.17	□□□□□ -1.9
SIP1	P32578	VID24	YBR105C	1089 nt		3.17	□□□□□ -1.9
SIP1	P32578	YRR1	YOR162C	2433 nt		3.17	□□□□□ -1.9
SIP1	P32578	GDI1	YER136W	1356 nt		3.16	□□□□□ -1.9
SIP1	P32578	HNT1	YDL125C	477 nt		3.16	□□□□□ -1.9
SIP1	P32578	YDL242W	YDL242W	354 nt		3.16	□□□□□ -1.9
SIP1	P32578	YDR246W-A	YDR246W-A	201 nt		3.16	□□□□□ -1.9
SIP1	P32578	AGA2	YGL032C	264 nt		3.16	□□□□□ -1.9
SIP1	P32578	RPB9	YGL070C	369 nt		3.16	□□□□□ -1.9
SIP1	P32578	RPS23A	YGR118W	438 nt		3.16	□□□□□ -1.9
SIP1	P32578	DAD2	YKR083C	402 nt		3.16	□□□□□ -1.9
SIP1	P32578	RAD33	YML011C	534 nt		3.16	□□□□□ -1.9
SIP1	P32578	CTK3	YML112W	891 nt		3.16	□□□□□ -1.9
SIP1	P32578	YBR076C-A	YBR076C-A	267 nt		3.16	□□□□□ -1.9
SIP1	P32578	RPS23B	YPR132W	438 nt		3.16	□□□□□ -1.9
SIP1	P32578	AIM4	YBR194W	372 nt		3.16	□□□□□ -1.9
SIP1	P32578	RRI2	YOL117W	1938 nt		3.16	□□□□□ -1.9
SIP1	P32578	SNT1	YCR033W	3681 nt		3.16	□□□□□ -1.9
SIP1	P32578	YAK1	YJL141C	2424 nt		3.15	□□□□□ -1.9
SIP1	P32578	RRP5	YMR229C	5190 nt		3.15	□□□□□ -1.9
SIP1	P32578	YCR090C	YCR090C	549 nt		3.15	□□□□□ -1.91
SIP1	P32578	FAP7	YDL166C	594 nt		3.15	□□□□□ -1.91
SIP1	P32578	GLC3	YEL011W	2115 nt		3.15	□□□□□ -1.91
SIP1	P32578	YGR242W	YGR242W	309 nt		3.15	□□□□□ -1.91
SIP1	P32578	HIS5	YIL116W	1158 nt		3.15	□□□□□ -1.91
SIP1	P32578	YLR334C	YLR334C	381 nt		3.15	□□□□□ -1.91
SIP1	P32578	YNL046W	YNL046W	519 nt		3.15	□□□□□ -1.91
SIP1	P32578	ATG3	YNR007C	933 nt		3.15	□□□□□ -1.91
SIP1	P32578	RPS7A	YOR096W	573 nt		3.15	□□□□□ -1.91
SIP1	P32578	PFY1	YOR122C	381 nt		3.15	□□□□□ -1.91
SIP1	P32578	YOR131C	YOR131C	657 nt		3.15	□□□□□ -1.91
SIP1	P32578	PSY4	YBL046W	1326 nt		3.15	□□□□□ -1.91
SIP1	P32578	SSF1	YHR066W	1362 nt		3.14	□□□□□ -1.91
SIP1	P32578	LCB4	YOR171C	1875 nt		3.14	□□□□□ -1.91
SIP1	P32578	PPH3	YDR075W	927 nt		3.14	□□□□□ -1.91
SIP1	P32578	YER039C-A	YER039C-A	219 nt		3.14	□□□□□ -1.91
SIP1	P32578	YGL015C	YGL015C	393 nt		3.14	□□□□□ -1.91
SIP1	P32578	RPS28B	YLR264W	204 nt		3.14	□□□□□ -1.91
SIP1	P32578	YMR141C	YMR141C	309 nt		3.14	□□□□□ -1.91
SIP1	P32578	YNR021W	YNR021W	1215 nt		3.14	□□□□□ -1.91
SIP1	P32578	RRG8	YPR116W	834 nt		3.14	□□□□□ -1.91
SIP1	P32578	YPR170W-A	YPR170W-A	186 nt		3.14	□□□□□ -1.91
SIP1	P32578	ARO80	YDR421W	2853 nt		3.14	□□□□□ -1.91
SIP1	P32578	HFM1	YGL251C	3564 nt		3.14	□□□□□ -1.91
SIP1	P32578	KIN2	YLR096W	3444 nt		3.14	□□□□□ -1.91
SIP1	P32578	21S_rRNA	21S_rRNA	3296 nt		3.14	□□□□□ -1.91
SIP1	P32578	TFC1	YBR123C	1950 nt		3.14	□□□□□ -1.91
SIP1	P32578	GIM4	YEL003W	336 nt		3.13	□□□□□ -1.91
SIP1	P32578	GET1	YGL020C	708 nt		3.13	□□□□□ -1.91
SIP1	P32578	YGL042C	YGL042C	306 nt		3.13	□□□□□ -1.91
SIP1	P32578	RPS4B	YHR203C	786 nt		3.13	□□□□□ -1.91
SIP1	P32578	DLS1	YJL065C	504 nt		3.13	□□□□□ -1.91
SIP1	P32578	YJL169W	YJL169W	369 nt		3.13	□□□□□ -1.91
SIP1	P32578	YOL085W-A	YOL085W-A	213 nt		3.13	□□□□□ -1.91
SIP1	P32578	FYV12	YOR183W	390 nt		3.13	□□□□□ -1.91
SIP1	P32578	snR41	snR41	95 nt		3.13	□□□□□ -1.91
SIP1	P32578	HOP1	YIL072W	1818 nt		3.13	□□□□□ -1.91
SIP1	P32578	BI4	Q0120	1917 nt		3.13	□□□□□ -1.91
SIP1	P32578	VBA4	YDR119W	2307 nt		3.13	□□□□□ -1.91
SIP1	P32578	USA1	YML029W	2517 nt		3.13	□□□□□ -1.91
SIP1	P32578	URB2	YJR041C	3525 nt		3.13	□□□□□ -1.91
SIP1	P32578	MSD1	YPL104W	1977 nt		3.12	□□□□□ -1.91
SIP1	P32578	YEL025C	YEL025C	3567 nt		3.12	□□□□□ -1.91
SIP1	P32578	SMC2	YFR031C	3513 nt		3.12	□□□□□ -1.91
SIP1	P32578	RPI1	YIL119C	1224 nt		3.12	□□□□□ -1.91
SIP1	P32578	ILV5	YLR355C	1188 nt		3.12	□□□□□ -1.91
SIP1	P32578	YLR406C-A	YLR406C-A	150 nt		3.12	□□□□□ -1.91
SIP1	P32578	OST6	YML019W	999 nt		3.12	□□□□□ -1.91
SIP1	P32578	RPL23A	YBL087C	414 nt		3.12	□□□□□ -1.91
SIP1	P32578	LEE1	YPL054W	906 nt		3.12	□□□□□ -1.91
SIP1	P32578	SSP1	YHR184W	1716 nt		3.12	□□□□□ -1.91
SIP1	P32578	MSH4	YFL003C	2637 nt		3.12	□□□□□ -1.91
SIP1	P32578	MUD2	YKL074C	1584 nt		3.12	□□□□□ -1.91

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