Protein–RNA interactions for Protein: P31941

APOBEC3A, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3AP31941 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
APOBEC3AP31941 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC17.76■□□□□ 0.43
APOBEC3AP31941 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC17.76■□□□□ 0.43
APOBEC3AP31941 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
APOBEC3AP31941 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
APOBEC3AP31941 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
APOBEC3AP31941 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
APOBEC3AP31941 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
APOBEC3AP31941 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
APOBEC3AP31941 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
APOBEC3AP31941 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
APOBEC3AP31941 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
APOBEC3AP31941 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
APOBEC3AP31941 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
APOBEC3AP31941 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
APOBEC3AP31941 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
APOBEC3AP31941 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
APOBEC3AP31941 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
APOBEC3AP31941 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC17.75■□□□□ 0.43
APOBEC3AP31941 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
APOBEC3AP31941 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
APOBEC3AP31941 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
APOBEC3AP31941 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
APOBEC3AP31941 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
APOBEC3AP31941 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
APOBEC3AP31941 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
APOBEC3AP31941 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
APOBEC3AP31941 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
APOBEC3AP31941 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
APOBEC3AP31941 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
APOBEC3AP31941 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
APOBEC3AP31941 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
APOBEC3AP31941 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
APOBEC3AP31941 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
APOBEC3AP31941 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
APOBEC3AP31941 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
APOBEC3AP31941 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
APOBEC3AP31941 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
APOBEC3AP31941 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC17.74■□□□□ 0.43
APOBEC3AP31941 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
APOBEC3AP31941 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC17.74■□□□□ 0.43
APOBEC3AP31941 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
APOBEC3AP31941 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
APOBEC3AP31941 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
APOBEC3AP31941 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
APOBEC3AP31941 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
APOBEC3AP31941 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
APOBEC3AP31941 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
APOBEC3AP31941 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
APOBEC3AP31941 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
APOBEC3AP31941 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC17.73■□□□□ 0.43
APOBEC3AP31941 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
APOBEC3AP31941 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
APOBEC3AP31941 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC17.73■□□□□ 0.43
APOBEC3AP31941 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
APOBEC3AP31941 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
APOBEC3AP31941 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
APOBEC3AP31941 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
APOBEC3AP31941 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
APOBEC3AP31941 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
APOBEC3AP31941 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
APOBEC3AP31941 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
APOBEC3AP31941 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
APOBEC3AP31941 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
APOBEC3AP31941 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
APOBEC3AP31941 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
APOBEC3AP31941 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
APOBEC3AP31941 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
APOBEC3AP31941 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
APOBEC3AP31941 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
APOBEC3AP31941 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
APOBEC3AP31941 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
APOBEC3AP31941 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
APOBEC3AP31941 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
APOBEC3AP31941 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
APOBEC3AP31941 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
APOBEC3AP31941 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
APOBEC3AP31941 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
APOBEC3AP31941 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
APOBEC3AP31941 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
APOBEC3AP31941 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
APOBEC3AP31941 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
APOBEC3AP31941 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
APOBEC3AP31941 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
APOBEC3AP31941 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
APOBEC3AP31941 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
APOBEC3AP31941 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
APOBEC3AP31941 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
APOBEC3AP31941 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
APOBEC3AP31941 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
APOBEC3AP31941 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
APOBEC3AP31941 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
APOBEC3AP31941 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
APOBEC3AP31941 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
APOBEC3AP31941 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
APOBEC3AP31941 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
APOBEC3AP31941 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
APOBEC3AP31941 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
APOBEC3AP31941 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
APOBEC3AP31941 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.3 ms