Protein–RNA interactions for Protein: P29966

MARCKS, Myristoylated alanine-rich C-kinase substrate, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MARCKSP29966 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
MARCKSP29966 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
MARCKSP29966 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
MARCKSP29966 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
MARCKSP29966 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
MARCKSP29966 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
MARCKSP29966 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
MARCKSP29966 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
MARCKSP29966 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
MARCKSP29966 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
MARCKSP29966 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
MARCKSP29966 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
MARCKSP29966 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
MARCKSP29966 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
MARCKSP29966 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
MARCKSP29966 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
MARCKSP29966 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
MARCKSP29966 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
MARCKSP29966 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
MARCKSP29966 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
MARCKSP29966 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
MARCKSP29966 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
MARCKSP29966 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
MARCKSP29966 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
MARCKSP29966 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
MARCKSP29966 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
MARCKSP29966 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
MARCKSP29966 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
MARCKSP29966 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
MARCKSP29966 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
MARCKSP29966 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
MARCKSP29966 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
MARCKSP29966 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
MARCKSP29966 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
MARCKSP29966 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
MARCKSP29966 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
MARCKSP29966 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
MARCKSP29966 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
MARCKSP29966 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
MARCKSP29966 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
MARCKSP29966 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
MARCKSP29966 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
MARCKSP29966 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
MARCKSP29966 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
MARCKSP29966 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
MARCKSP29966 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
MARCKSP29966 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
MARCKSP29966 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
MARCKSP29966 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
MARCKSP29966 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
MARCKSP29966 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
MARCKSP29966 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
MARCKSP29966 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
MARCKSP29966 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
MARCKSP29966 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
MARCKSP29966 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
MARCKSP29966 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
MARCKSP29966 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
MARCKSP29966 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
MARCKSP29966 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
MARCKSP29966 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
MARCKSP29966 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
MARCKSP29966 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
MARCKSP29966 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
MARCKSP29966 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
MARCKSP29966 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
MARCKSP29966 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
MARCKSP29966 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
MARCKSP29966 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
MARCKSP29966 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
MARCKSP29966 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
MARCKSP29966 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
MARCKSP29966 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
MARCKSP29966 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
MARCKSP29966 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
MARCKSP29966 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
MARCKSP29966 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
MARCKSP29966 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
MARCKSP29966 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
MARCKSP29966 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
MARCKSP29966 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
MARCKSP29966 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
MARCKSP29966 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
MARCKSP29966 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
MARCKSP29966 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
MARCKSP29966 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
MARCKSP29966 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
MARCKSP29966 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC23.65■■□□□ 1.38
MARCKSP29966 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
MARCKSP29966 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
MARCKSP29966 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
MARCKSP29966 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
MARCKSP29966 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
MARCKSP29966 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
MARCKSP29966 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
MARCKSP29966 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
MARCKSP29966 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
MARCKSP29966 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
MARCKSP29966 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
MARCKSP29966 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms