Protein–RNA interactions for Protein: P29536

LMOD1, Leiomodin-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 600 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMOD1P29536 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
LMOD1P29536 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
LMOD1P29536 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
LMOD1P29536 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
LMOD1P29536 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
LMOD1P29536 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
LMOD1P29536 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
LMOD1P29536 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
LMOD1P29536 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
LMOD1P29536 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
LMOD1P29536 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
LMOD1P29536 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
LMOD1P29536 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
LMOD1P29536 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
LMOD1P29536 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
LMOD1P29536 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
LMOD1P29536 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
LMOD1P29536 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
LMOD1P29536 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
LMOD1P29536 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
LMOD1P29536 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
LMOD1P29536 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
LMOD1P29536 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
LMOD1P29536 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
LMOD1P29536 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
LMOD1P29536 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
LMOD1P29536 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
LMOD1P29536 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
LMOD1P29536 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
LMOD1P29536 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
LMOD1P29536 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
LMOD1P29536 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
LMOD1P29536 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
LMOD1P29536 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
LMOD1P29536 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
LMOD1P29536 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
LMOD1P29536 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
LMOD1P29536 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
LMOD1P29536 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
LMOD1P29536 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
LMOD1P29536 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
LMOD1P29536 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
LMOD1P29536 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
LMOD1P29536 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
LMOD1P29536 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
LMOD1P29536 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
LMOD1P29536 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
LMOD1P29536 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
LMOD1P29536 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
LMOD1P29536 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
LMOD1P29536 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
LMOD1P29536 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
LMOD1P29536 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
LMOD1P29536 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
LMOD1P29536 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
LMOD1P29536 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
LMOD1P29536 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
LMOD1P29536 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
LMOD1P29536 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
LMOD1P29536 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
LMOD1P29536 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
LMOD1P29536 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
LMOD1P29536 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
LMOD1P29536 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
LMOD1P29536 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
LMOD1P29536 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
LMOD1P29536 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
LMOD1P29536 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
LMOD1P29536 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
LMOD1P29536 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
LMOD1P29536 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
LMOD1P29536 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
LMOD1P29536 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
LMOD1P29536 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
LMOD1P29536 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
LMOD1P29536 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
LMOD1P29536 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
LMOD1P29536 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
LMOD1P29536 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
LMOD1P29536 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
LMOD1P29536 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
LMOD1P29536 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
LMOD1P29536 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
LMOD1P29536 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
LMOD1P29536 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
LMOD1P29536 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
LMOD1P29536 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
LMOD1P29536 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
LMOD1P29536 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
LMOD1P29536 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
LMOD1P29536 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
LMOD1P29536 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
LMOD1P29536 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
LMOD1P29536 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
LMOD1P29536 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
LMOD1P29536 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
LMOD1P29536 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
LMOD1P29536 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
LMOD1P29536 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
LMOD1P29536 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms