Protein–RNA interactions for Protein: P28906

CD34, Hematopoietic progenitor cell antigen CD34, humanhuman

Predictions only

Length 385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD34P28906 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CD34P28906 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CD34P28906 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CD34P28906 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CD34P28906 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CD34P28906 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CD34P28906 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CD34P28906 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CD34P28906 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CD34P28906 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
CD34P28906 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CD34P28906 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CD34P28906 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CD34P28906 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CD34P28906 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CD34P28906 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CD34P28906 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CD34P28906 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CD34P28906 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CD34P28906 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CD34P28906 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CD34P28906 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CD34P28906 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CD34P28906 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
CD34P28906 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CD34P28906 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CD34P28906 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CD34P28906 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CD34P28906 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CD34P28906 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CD34P28906 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CD34P28906 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CD34P28906 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CD34P28906 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CD34P28906 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CD34P28906 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CD34P28906 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CD34P28906 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CD34P28906 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CD34P28906 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CD34P28906 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CD34P28906 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CD34P28906 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
CD34P28906 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CD34P28906 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CD34P28906 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CD34P28906 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CD34P28906 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CD34P28906 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CD34P28906 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
CD34P28906 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
CD34P28906 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CD34P28906 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CD34P28906 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CD34P28906 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CD34P28906 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CD34P28906 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
CD34P28906 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CD34P28906 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CD34P28906 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CD34P28906 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CD34P28906 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CD34P28906 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CD34P28906 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CD34P28906 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CD34P28906 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CD34P28906 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CD34P28906 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CD34P28906 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CD34P28906 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CD34P28906 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
CD34P28906 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CD34P28906 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
CD34P28906 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CD34P28906 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
CD34P28906 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CD34P28906 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CD34P28906 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CD34P28906 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
CD34P28906 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
CD34P28906 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
CD34P28906 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CD34P28906 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
CD34P28906 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
CD34P28906 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
CD34P28906 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CD34P28906 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CD34P28906 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CD34P28906 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CD34P28906 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CD34P28906 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CD34P28906 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CD34P28906 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CD34P28906 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CD34P28906 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CD34P28906 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CD34P28906 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
CD34P28906 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
CD34P28906 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CD34P28906 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms