Protein–RNA interactions for Protein: P28328

PEX2, Peroxisome biogenesis factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX2P28328 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PEX2P28328 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PEX2P28328 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PEX2P28328 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PEX2P28328 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PEX2P28328 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PEX2P28328 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PEX2P28328 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PEX2P28328 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PEX2P28328 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PEX2P28328 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PEX2P28328 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PEX2P28328 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PEX2P28328 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PEX2P28328 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PEX2P28328 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PEX2P28328 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PEX2P28328 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PEX2P28328 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PEX2P28328 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PEX2P28328 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PEX2P28328 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PEX2P28328 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PEX2P28328 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PEX2P28328 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PEX2P28328 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PEX2P28328 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PEX2P28328 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PEX2P28328 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PEX2P28328 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PEX2P28328 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
PEX2P28328 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PEX2P28328 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
PEX2P28328 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
PEX2P28328 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PEX2P28328 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PEX2P28328 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PEX2P28328 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PEX2P28328 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PEX2P28328 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PEX2P28328 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PEX2P28328 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PEX2P28328 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PEX2P28328 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PEX2P28328 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PEX2P28328 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PEX2P28328 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PEX2P28328 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PEX2P28328 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
PEX2P28328 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PEX2P28328 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
PEX2P28328 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PEX2P28328 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PEX2P28328 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PEX2P28328 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PEX2P28328 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PEX2P28328 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PEX2P28328 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PEX2P28328 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PEX2P28328 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PEX2P28328 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PEX2P28328 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PEX2P28328 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PEX2P28328 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PEX2P28328 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PEX2P28328 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PEX2P28328 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PEX2P28328 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
PEX2P28328 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PEX2P28328 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PEX2P28328 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
PEX2P28328 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PEX2P28328 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PEX2P28328 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PEX2P28328 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PEX2P28328 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PEX2P28328 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PEX2P28328 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PEX2P28328 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PEX2P28328 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PEX2P28328 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PEX2P28328 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PEX2P28328 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PEX2P28328 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PEX2P28328 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PEX2P28328 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PEX2P28328 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PEX2P28328 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PEX2P28328 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
PEX2P28328 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PEX2P28328 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PEX2P28328 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
PEX2P28328 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
PEX2P28328 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PEX2P28328 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PEX2P28328 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PEX2P28328 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PEX2P28328 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PEX2P28328 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PEX2P28328 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms