Protein–RNA interactions for Protein: P25774

CTSS, Cathepsin S, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSSP25774 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CTSSP25774 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CTSSP25774 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CTSSP25774 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CTSSP25774 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CTSSP25774 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CTSSP25774 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CTSSP25774 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CTSSP25774 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CTSSP25774 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CTSSP25774 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CTSSP25774 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CTSSP25774 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CTSSP25774 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CTSSP25774 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CTSSP25774 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CTSSP25774 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CTSSP25774 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CTSSP25774 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CTSSP25774 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
CTSSP25774 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
CTSSP25774 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
CTSSP25774 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CTSSP25774 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CTSSP25774 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CTSSP25774 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CTSSP25774 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CTSSP25774 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CTSSP25774 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CTSSP25774 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CTSSP25774 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CTSSP25774 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CTSSP25774 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CTSSP25774 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CTSSP25774 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CTSSP25774 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CTSSP25774 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CTSSP25774 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
CTSSP25774 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
CTSSP25774 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CTSSP25774 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CTSSP25774 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
CTSSP25774 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CTSSP25774 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
CTSSP25774 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
CTSSP25774 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CTSSP25774 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CTSSP25774 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CTSSP25774 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CTSSP25774 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CTSSP25774 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CTSSP25774 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CTSSP25774 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CTSSP25774 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CTSSP25774 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CTSSP25774 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CTSSP25774 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CTSSP25774 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CTSSP25774 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CTSSP25774 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CTSSP25774 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CTSSP25774 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CTSSP25774 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CTSSP25774 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
CTSSP25774 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CTSSP25774 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CTSSP25774 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CTSSP25774 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CTSSP25774 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CTSSP25774 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CTSSP25774 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CTSSP25774 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CTSSP25774 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CTSSP25774 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CTSSP25774 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CTSSP25774 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CTSSP25774 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CTSSP25774 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CTSSP25774 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CTSSP25774 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CTSSP25774 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
CTSSP25774 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CTSSP25774 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CTSSP25774 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CTSSP25774 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CTSSP25774 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CTSSP25774 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CTSSP25774 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CTSSP25774 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CTSSP25774 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CTSSP25774 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CTSSP25774 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CTSSP25774 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CTSSP25774 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CTSSP25774 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CTSSP25774 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
CTSSP25774 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CTSSP25774 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CTSSP25774 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CTSSP25774 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms