Protein–RNA interactions for Protein: P24928

POLR2A, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,970 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2AP24928 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.73■■□□□ 1.55
POLR2AP24928 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
POLR2AP24928 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
POLR2AP24928 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
POLR2AP24928 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
POLR2AP24928 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
POLR2AP24928 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
POLR2AP24928 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
POLR2AP24928 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
POLR2AP24928 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
POLR2AP24928 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
POLR2AP24928 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
POLR2AP24928 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
POLR2AP24928 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
POLR2AP24928 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
POLR2AP24928 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
POLR2AP24928 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
POLR2AP24928 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
POLR2AP24928 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
POLR2AP24928 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
POLR2AP24928 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
POLR2AP24928 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
POLR2AP24928 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
POLR2AP24928 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
POLR2AP24928 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
POLR2AP24928 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
POLR2AP24928 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
POLR2AP24928 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
POLR2AP24928 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
POLR2AP24928 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
POLR2AP24928 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
POLR2AP24928 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
POLR2AP24928 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
POLR2AP24928 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
POLR2AP24928 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
POLR2AP24928 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.55
POLR2AP24928 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
POLR2AP24928 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
POLR2AP24928 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
POLR2AP24928 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
POLR2AP24928 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
POLR2AP24928 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
POLR2AP24928 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
POLR2AP24928 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
POLR2AP24928 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
POLR2AP24928 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
POLR2AP24928 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
POLR2AP24928 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
POLR2AP24928 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
POLR2AP24928 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
POLR2AP24928 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
POLR2AP24928 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
POLR2AP24928 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
POLR2AP24928 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
POLR2AP24928 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
POLR2AP24928 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
POLR2AP24928 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
POLR2AP24928 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
POLR2AP24928 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
POLR2AP24928 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
POLR2AP24928 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
POLR2AP24928 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
POLR2AP24928 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
POLR2AP24928 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
POLR2AP24928 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
POLR2AP24928 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
POLR2AP24928 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
POLR2AP24928 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
POLR2AP24928 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
POLR2AP24928 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
POLR2AP24928 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
POLR2AP24928 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
POLR2AP24928 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
POLR2AP24928 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
POLR2AP24928 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
POLR2AP24928 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
POLR2AP24928 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
POLR2AP24928 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC24.68■■□□□ 1.54
POLR2AP24928 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
POLR2AP24928 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
POLR2AP24928 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
POLR2AP24928 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
POLR2AP24928 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
POLR2AP24928 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
POLR2AP24928 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
POLR2AP24928 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
POLR2AP24928 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
POLR2AP24928 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
POLR2AP24928 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
POLR2AP24928 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
POLR2AP24928 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
POLR2AP24928 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
POLR2AP24928 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
POLR2AP24928 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
POLR2AP24928 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
POLR2AP24928 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
POLR2AP24928 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
POLR2AP24928 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
POLR2AP24928 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
POLR2AP24928 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms