Protein–RNA interactions for Protein: P23469

PTPRE, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPREP23469 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PTPREP23469 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PTPREP23469 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
PTPREP23469 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
PTPREP23469 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PTPREP23469 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PTPREP23469 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PTPREP23469 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PTPREP23469 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PTPREP23469 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PTPREP23469 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PTPREP23469 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PTPREP23469 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PTPREP23469 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
PTPREP23469 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
PTPREP23469 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PTPREP23469 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PTPREP23469 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PTPREP23469 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PTPREP23469 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PTPREP23469 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
PTPREP23469 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PTPREP23469 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PTPREP23469 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PTPREP23469 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PTPREP23469 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PTPREP23469 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PTPREP23469 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PTPREP23469 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PTPREP23469 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PTPREP23469 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PTPREP23469 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PTPREP23469 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PTPREP23469 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PTPREP23469 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PTPREP23469 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PTPREP23469 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PTPREP23469 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PTPREP23469 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PTPREP23469 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PTPREP23469 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PTPREP23469 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PTPREP23469 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PTPREP23469 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PTPREP23469 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PTPREP23469 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PTPREP23469 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PTPREP23469 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PTPREP23469 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PTPREP23469 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PTPREP23469 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PTPREP23469 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PTPREP23469 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PTPREP23469 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PTPREP23469 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PTPREP23469 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PTPREP23469 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PTPREP23469 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PTPREP23469 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PTPREP23469 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PTPREP23469 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PTPREP23469 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PTPREP23469 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
PTPREP23469 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PTPREP23469 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PTPREP23469 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
PTPREP23469 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PTPREP23469 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PTPREP23469 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PTPREP23469 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PTPREP23469 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PTPREP23469 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PTPREP23469 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PTPREP23469 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PTPREP23469 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
PTPREP23469 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
PTPREP23469 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PTPREP23469 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PTPREP23469 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PTPREP23469 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PTPREP23469 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PTPREP23469 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PTPREP23469 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
PTPREP23469 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PTPREP23469 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PTPREP23469 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PTPREP23469 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PTPREP23469 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PTPREP23469 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PTPREP23469 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PTPREP23469 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PTPREP23469 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PTPREP23469 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PTPREP23469 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PTPREP23469 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PTPREP23469 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PTPREP23469 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PTPREP23469 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PTPREP23469 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PTPREP23469 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
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