Protein–RNA interactions for Protein: P20783

NTF3, Neurotrophin-3, humanhuman

Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTF3P20783 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NTF3P20783 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NTF3P20783 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NTF3P20783 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NTF3P20783 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NTF3P20783 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NTF3P20783 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NTF3P20783 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NTF3P20783 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NTF3P20783 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NTF3P20783 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NTF3P20783 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NTF3P20783 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NTF3P20783 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NTF3P20783 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NTF3P20783 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NTF3P20783 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NTF3P20783 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NTF3P20783 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NTF3P20783 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NTF3P20783 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NTF3P20783 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NTF3P20783 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NTF3P20783 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NTF3P20783 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NTF3P20783 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NTF3P20783 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NTF3P20783 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NTF3P20783 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NTF3P20783 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NTF3P20783 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NTF3P20783 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NTF3P20783 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NTF3P20783 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NTF3P20783 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NTF3P20783 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NTF3P20783 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NTF3P20783 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NTF3P20783 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
NTF3P20783 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NTF3P20783 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NTF3P20783 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NTF3P20783 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NTF3P20783 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NTF3P20783 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NTF3P20783 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NTF3P20783 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NTF3P20783 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NTF3P20783 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NTF3P20783 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NTF3P20783 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NTF3P20783 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NTF3P20783 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
NTF3P20783 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NTF3P20783 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NTF3P20783 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NTF3P20783 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NTF3P20783 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NTF3P20783 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NTF3P20783 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NTF3P20783 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NTF3P20783 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NTF3P20783 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NTF3P20783 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NTF3P20783 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NTF3P20783 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NTF3P20783 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NTF3P20783 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NTF3P20783 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NTF3P20783 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NTF3P20783 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NTF3P20783 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NTF3P20783 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NTF3P20783 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NTF3P20783 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NTF3P20783 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NTF3P20783 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NTF3P20783 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
NTF3P20783 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NTF3P20783 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
NTF3P20783 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NTF3P20783 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NTF3P20783 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NTF3P20783 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NTF3P20783 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NTF3P20783 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NTF3P20783 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NTF3P20783 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NTF3P20783 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NTF3P20783 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NTF3P20783 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NTF3P20783 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NTF3P20783 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NTF3P20783 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NTF3P20783 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NTF3P20783 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NTF3P20783 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NTF3P20783 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
NTF3P20783 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NTF3P20783 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms