Protein–RNA interactions for Protein: P17600

SYN1, Synapsin-1, humanhuman

Predictions only

Length 705 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYN1P17600 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SYN1P17600 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SYN1P17600 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SYN1P17600 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SYN1P17600 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SYN1P17600 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SYN1P17600 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SYN1P17600 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
SYN1P17600 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SYN1P17600 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SYN1P17600 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SYN1P17600 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SYN1P17600 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SYN1P17600 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SYN1P17600 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SYN1P17600 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SYN1P17600 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SYN1P17600 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SYN1P17600 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SYN1P17600 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SYN1P17600 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SYN1P17600 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SYN1P17600 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SYN1P17600 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SYN1P17600 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SYN1P17600 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SYN1P17600 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SYN1P17600 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SYN1P17600 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SYN1P17600 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SYN1P17600 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SYN1P17600 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
SYN1P17600 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SYN1P17600 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SYN1P17600 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SYN1P17600 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SYN1P17600 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SYN1P17600 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SYN1P17600 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SYN1P17600 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SYN1P17600 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SYN1P17600 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SYN1P17600 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SYN1P17600 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SYN1P17600 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SYN1P17600 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SYN1P17600 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SYN1P17600 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SYN1P17600 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SYN1P17600 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SYN1P17600 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SYN1P17600 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SYN1P17600 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
SYN1P17600 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SYN1P17600 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SYN1P17600 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SYN1P17600 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SYN1P17600 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SYN1P17600 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SYN1P17600 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SYN1P17600 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SYN1P17600 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
SYN1P17600 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SYN1P17600 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SYN1P17600 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SYN1P17600 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SYN1P17600 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SYN1P17600 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
SYN1P17600 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SYN1P17600 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SYN1P17600 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SYN1P17600 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SYN1P17600 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SYN1P17600 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SYN1P17600 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SYN1P17600 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SYN1P17600 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
SYN1P17600 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SYN1P17600 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SYN1P17600 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SYN1P17600 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
SYN1P17600 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
SYN1P17600 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SYN1P17600 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SYN1P17600 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SYN1P17600 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
SYN1P17600 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SYN1P17600 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SYN1P17600 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SYN1P17600 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SYN1P17600 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SYN1P17600 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SYN1P17600 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SYN1P17600 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SYN1P17600 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SYN1P17600 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SYN1P17600 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SYN1P17600 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SYN1P17600 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SYN1P17600 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms