Protein–RNA interactions for Protein: P17066

HSPA6, Heat shock 70 kDa protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 643 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSPA6P17066 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
HSPA6P17066 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
HSPA6P17066 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
HSPA6P17066 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
HSPA6P17066 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
HSPA6P17066 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
HSPA6P17066 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
HSPA6P17066 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
HSPA6P17066 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
HSPA6P17066 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
HSPA6P17066 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
HSPA6P17066 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
HSPA6P17066 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
HSPA6P17066 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
HSPA6P17066 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
HSPA6P17066 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
HSPA6P17066 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC24.95■■□□□ 1.59
HSPA6P17066 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
HSPA6P17066 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
HSPA6P17066 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
HSPA6P17066 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
HSPA6P17066 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
HSPA6P17066 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
HSPA6P17066 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
HSPA6P17066 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
HSPA6P17066 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC24.95■■□□□ 1.58
HSPA6P17066 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
HSPA6P17066 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC24.95■■□□□ 1.58
HSPA6P17066 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
HSPA6P17066 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
HSPA6P17066 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
HSPA6P17066 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
HSPA6P17066 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
HSPA6P17066 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
HSPA6P17066 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
HSPA6P17066 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
HSPA6P17066 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
HSPA6P17066 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
HSPA6P17066 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
HSPA6P17066 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
HSPA6P17066 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
HSPA6P17066 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
HSPA6P17066 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
HSPA6P17066 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
HSPA6P17066 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
HSPA6P17066 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
HSPA6P17066 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
HSPA6P17066 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
HSPA6P17066 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
HSPA6P17066 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
HSPA6P17066 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
HSPA6P17066 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
HSPA6P17066 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
HSPA6P17066 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
HSPA6P17066 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
HSPA6P17066 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
HSPA6P17066 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
HSPA6P17066 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
HSPA6P17066 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
HSPA6P17066 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
HSPA6P17066 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
HSPA6P17066 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
HSPA6P17066 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
HSPA6P17066 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
HSPA6P17066 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
HSPA6P17066 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
HSPA6P17066 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
HSPA6P17066 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
HSPA6P17066 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
HSPA6P17066 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
HSPA6P17066 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
HSPA6P17066 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
HSPA6P17066 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
HSPA6P17066 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
HSPA6P17066 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
HSPA6P17066 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
HSPA6P17066 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
HSPA6P17066 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
HSPA6P17066 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
HSPA6P17066 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
HSPA6P17066 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
HSPA6P17066 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
HSPA6P17066 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
HSPA6P17066 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
HSPA6P17066 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
HSPA6P17066 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
HSPA6P17066 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
HSPA6P17066 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
HSPA6P17066 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
HSPA6P17066 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
HSPA6P17066 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
HSPA6P17066 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
HSPA6P17066 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
HSPA6P17066 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
HSPA6P17066 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
HSPA6P17066 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
HSPA6P17066 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
HSPA6P17066 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
HSPA6P17066 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
HSPA6P17066 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms