Protein–RNA interactions for Protein: P16410

CTLA4, Cytotoxic T-lymphocyte protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 223 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTLA4P16410 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CTLA4P16410 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CTLA4P16410 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CTLA4P16410 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CTLA4P16410 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CTLA4P16410 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CTLA4P16410 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CTLA4P16410 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CTLA4P16410 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CTLA4P16410 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CTLA4P16410 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CTLA4P16410 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CTLA4P16410 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CTLA4P16410 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CTLA4P16410 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CTLA4P16410 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CTLA4P16410 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CTLA4P16410 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CTLA4P16410 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CTLA4P16410 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CTLA4P16410 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CTLA4P16410 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CTLA4P16410 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CTLA4P16410 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CTLA4P16410 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CTLA4P16410 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CTLA4P16410 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CTLA4P16410 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CTLA4P16410 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CTLA4P16410 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CTLA4P16410 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CTLA4P16410 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CTLA4P16410 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CTLA4P16410 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CTLA4P16410 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CTLA4P16410 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CTLA4P16410 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CTLA4P16410 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CTLA4P16410 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CTLA4P16410 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CTLA4P16410 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CTLA4P16410 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CTLA4P16410 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CTLA4P16410 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CTLA4P16410 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CTLA4P16410 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CTLA4P16410 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CTLA4P16410 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CTLA4P16410 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CTLA4P16410 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CTLA4P16410 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CTLA4P16410 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CTLA4P16410 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CTLA4P16410 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CTLA4P16410 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CTLA4P16410 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CTLA4P16410 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CTLA4P16410 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CTLA4P16410 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CTLA4P16410 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CTLA4P16410 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CTLA4P16410 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CTLA4P16410 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
CTLA4P16410 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CTLA4P16410 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CTLA4P16410 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CTLA4P16410 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CTLA4P16410 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CTLA4P16410 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CTLA4P16410 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CTLA4P16410 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CTLA4P16410 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CTLA4P16410 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CTLA4P16410 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CTLA4P16410 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CTLA4P16410 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CTLA4P16410 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CTLA4P16410 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CTLA4P16410 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CTLA4P16410 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CTLA4P16410 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CTLA4P16410 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CTLA4P16410 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CTLA4P16410 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CTLA4P16410 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
CTLA4P16410 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
CTLA4P16410 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CTLA4P16410 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
CTLA4P16410 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CTLA4P16410 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CTLA4P16410 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CTLA4P16410 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CTLA4P16410 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CTLA4P16410 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CTLA4P16410 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CTLA4P16410 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
CTLA4P16410 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
CTLA4P16410 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
CTLA4P16410 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CTLA4P16410 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms