Protein–RNA interactions for Protein: P16219

ACADS, Short-chain specific acyl-CoA dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACADSP16219 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ACADSP16219 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ACADSP16219 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ACADSP16219 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ACADSP16219 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ACADSP16219 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ACADSP16219 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ACADSP16219 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ACADSP16219 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ACADSP16219 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ACADSP16219 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ACADSP16219 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ACADSP16219 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ACADSP16219 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ACADSP16219 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ACADSP16219 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ACADSP16219 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ACADSP16219 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ACADSP16219 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ACADSP16219 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ACADSP16219 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ACADSP16219 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ACADSP16219 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ACADSP16219 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ACADSP16219 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ACADSP16219 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ACADSP16219 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ACADSP16219 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ACADSP16219 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ACADSP16219 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ACADSP16219 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ACADSP16219 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ACADSP16219 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ACADSP16219 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ACADSP16219 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ACADSP16219 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ACADSP16219 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ACADSP16219 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ACADSP16219 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ACADSP16219 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ACADSP16219 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ACADSP16219 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ACADSP16219 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ACADSP16219 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ACADSP16219 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ACADSP16219 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ACADSP16219 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
ACADSP16219 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ACADSP16219 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
ACADSP16219 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ACADSP16219 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ACADSP16219 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ACADSP16219 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ACADSP16219 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ACADSP16219 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ACADSP16219 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
ACADSP16219 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ACADSP16219 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ACADSP16219 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ACADSP16219 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ACADSP16219 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ACADSP16219 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ACADSP16219 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ACADSP16219 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ACADSP16219 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ACADSP16219 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ACADSP16219 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ACADSP16219 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
ACADSP16219 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ACADSP16219 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
ACADSP16219 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ACADSP16219 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ACADSP16219 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ACADSP16219 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ACADSP16219 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ACADSP16219 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ACADSP16219 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ACADSP16219 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ACADSP16219 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ACADSP16219 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ACADSP16219 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ACADSP16219 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ACADSP16219 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ACADSP16219 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ACADSP16219 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
ACADSP16219 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ACADSP16219 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ACADSP16219 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ACADSP16219 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ACADSP16219 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ACADSP16219 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ACADSP16219 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ACADSP16219 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ACADSP16219 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ACADSP16219 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ACADSP16219 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ACADSP16219 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ACADSP16219 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ACADSP16219 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ACADSP16219 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms