Protein–RNA interactions for Protein: P15692

VEGFA, Vascular endothelial growth factor A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VEGFAP15692 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
VEGFAP15692 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
VEGFAP15692 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
VEGFAP15692 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
VEGFAP15692 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
VEGFAP15692 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
VEGFAP15692 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
VEGFAP15692 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
VEGFAP15692 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
VEGFAP15692 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
VEGFAP15692 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
VEGFAP15692 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
VEGFAP15692 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
VEGFAP15692 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
VEGFAP15692 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
VEGFAP15692 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
VEGFAP15692 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
VEGFAP15692 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
VEGFAP15692 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
VEGFAP15692 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
VEGFAP15692 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
VEGFAP15692 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
VEGFAP15692 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
VEGFAP15692 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
VEGFAP15692 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
VEGFAP15692 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
VEGFAP15692 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
VEGFAP15692 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
VEGFAP15692 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
VEGFAP15692 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
VEGFAP15692 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
VEGFAP15692 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
VEGFAP15692 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
VEGFAP15692 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
VEGFAP15692 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
VEGFAP15692 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
VEGFAP15692 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
VEGFAP15692 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
VEGFAP15692 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
VEGFAP15692 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
VEGFAP15692 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
VEGFAP15692 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
VEGFAP15692 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
VEGFAP15692 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
VEGFAP15692 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.65
VEGFAP15692 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
VEGFAP15692 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
VEGFAP15692 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
VEGFAP15692 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
VEGFAP15692 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
VEGFAP15692 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
VEGFAP15692 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
VEGFAP15692 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
VEGFAP15692 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
VEGFAP15692 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
VEGFAP15692 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
VEGFAP15692 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
VEGFAP15692 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
VEGFAP15692 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
VEGFAP15692 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
VEGFAP15692 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
VEGFAP15692 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
VEGFAP15692 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
VEGFAP15692 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
VEGFAP15692 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
VEGFAP15692 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
VEGFAP15692 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.37■■□□□ 1.65
VEGFAP15692 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
VEGFAP15692 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
VEGFAP15692 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
VEGFAP15692 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
VEGFAP15692 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
VEGFAP15692 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
VEGFAP15692 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
VEGFAP15692 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
VEGFAP15692 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
VEGFAP15692 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
VEGFAP15692 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
VEGFAP15692 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
VEGFAP15692 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
VEGFAP15692 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
VEGFAP15692 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
VEGFAP15692 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
VEGFAP15692 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
VEGFAP15692 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
VEGFAP15692 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
VEGFAP15692 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
VEGFAP15692 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
VEGFAP15692 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
VEGFAP15692 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
VEGFAP15692 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC25.35■■□□□ 1.65
VEGFAP15692 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
VEGFAP15692 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
VEGFAP15692 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
VEGFAP15692 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
VEGFAP15692 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
VEGFAP15692 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
VEGFAP15692 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
VEGFAP15692 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
VEGFAP15692 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms