Protein–RNA interactions for Protein: P10720

PF4V1, Platelet factor 4 variant, humanhuman

Predictions only

Length 104 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PF4V1P10720 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PF4V1P10720 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PF4V1P10720 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PF4V1P10720 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PF4V1P10720 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PF4V1P10720 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PF4V1P10720 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PF4V1P10720 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PF4V1P10720 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PF4V1P10720 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PF4V1P10720 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PF4V1P10720 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
PF4V1P10720 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PF4V1P10720 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PF4V1P10720 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PF4V1P10720 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PF4V1P10720 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PF4V1P10720 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PF4V1P10720 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PF4V1P10720 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PF4V1P10720 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PF4V1P10720 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PF4V1P10720 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
PF4V1P10720 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PF4V1P10720 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PF4V1P10720 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PF4V1P10720 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PF4V1P10720 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PF4V1P10720 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
PF4V1P10720 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PF4V1P10720 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PF4V1P10720 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
PF4V1P10720 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PF4V1P10720 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PF4V1P10720 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PF4V1P10720 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PF4V1P10720 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PF4V1P10720 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PF4V1P10720 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PF4V1P10720 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PF4V1P10720 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PF4V1P10720 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PF4V1P10720 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PF4V1P10720 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PF4V1P10720 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PF4V1P10720 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PF4V1P10720 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PF4V1P10720 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PF4V1P10720 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PF4V1P10720 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PF4V1P10720 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
PF4V1P10720 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PF4V1P10720 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PF4V1P10720 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PF4V1P10720 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PF4V1P10720 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PF4V1P10720 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PF4V1P10720 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PF4V1P10720 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PF4V1P10720 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PF4V1P10720 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PF4V1P10720 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PF4V1P10720 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PF4V1P10720 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PF4V1P10720 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PF4V1P10720 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PF4V1P10720 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PF4V1P10720 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PF4V1P10720 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PF4V1P10720 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PF4V1P10720 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PF4V1P10720 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PF4V1P10720 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PF4V1P10720 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PF4V1P10720 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PF4V1P10720 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PF4V1P10720 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PF4V1P10720 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PF4V1P10720 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
PF4V1P10720 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PF4V1P10720 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PF4V1P10720 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
PF4V1P10720 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PF4V1P10720 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PF4V1P10720 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PF4V1P10720 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PF4V1P10720 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PF4V1P10720 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PF4V1P10720 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PF4V1P10720 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PF4V1P10720 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PF4V1P10720 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PF4V1P10720 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PF4V1P10720 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PF4V1P10720 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PF4V1P10720 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PF4V1P10720 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PF4V1P10720 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PF4V1P10720 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PF4V1P10720 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms