Protein–RNA interactions for Protein: P10072

HKR1, Krueppel-related zinc finger protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 659 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HKR1P10072 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
HKR1P10072 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
HKR1P10072 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
HKR1P10072 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
HKR1P10072 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HKR1P10072 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
HKR1P10072 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HKR1P10072 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HKR1P10072 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HKR1P10072 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HKR1P10072 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HKR1P10072 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HKR1P10072 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
HKR1P10072 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
HKR1P10072 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HKR1P10072 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
HKR1P10072 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
HKR1P10072 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
HKR1P10072 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
HKR1P10072 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC17.53■□□□□ 0.4
HKR1P10072 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
HKR1P10072 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
HKR1P10072 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
HKR1P10072 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HKR1P10072 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HKR1P10072 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
HKR1P10072 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
HKR1P10072 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HKR1P10072 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HKR1P10072 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HKR1P10072 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HKR1P10072 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
HKR1P10072 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
HKR1P10072 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
HKR1P10072 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
HKR1P10072 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
HKR1P10072 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
HKR1P10072 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
HKR1P10072 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
HKR1P10072 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
HKR1P10072 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
HKR1P10072 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
HKR1P10072 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
HKR1P10072 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
HKR1P10072 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
HKR1P10072 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC17.52■□□□□ 0.4
HKR1P10072 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
HKR1P10072 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
HKR1P10072 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.39
HKR1P10072 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
HKR1P10072 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
HKR1P10072 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
HKR1P10072 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
HKR1P10072 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
HKR1P10072 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
HKR1P10072 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
HKR1P10072 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
HKR1P10072 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
HKR1P10072 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
HKR1P10072 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
HKR1P10072 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
HKR1P10072 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
HKR1P10072 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
HKR1P10072 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
HKR1P10072 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
HKR1P10072 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
HKR1P10072 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
HKR1P10072 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
HKR1P10072 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
HKR1P10072 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
HKR1P10072 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
HKR1P10072 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
HKR1P10072 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
HKR1P10072 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
HKR1P10072 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
HKR1P10072 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
HKR1P10072 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
HKR1P10072 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
HKR1P10072 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
HKR1P10072 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
HKR1P10072 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
HKR1P10072 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
HKR1P10072 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC17.5■□□□□ 0.39
HKR1P10072 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
HKR1P10072 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
HKR1P10072 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
HKR1P10072 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
HKR1P10072 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
HKR1P10072 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
HKR1P10072 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
HKR1P10072 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
HKR1P10072 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
HKR1P10072 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
HKR1P10072 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
HKR1P10072 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
HKR1P10072 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
HKR1P10072 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
HKR1P10072 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
HKR1P10072 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
HKR1P10072 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms