Protein–RNA interactions for Protein: P0DN79

CBSL, Cystathionine beta-synthase-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBSLP0DN79 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CBSLP0DN79 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CBSLP0DN79 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CBSLP0DN79 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CBSLP0DN79 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CBSLP0DN79 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CBSLP0DN79 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CBSLP0DN79 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CBSLP0DN79 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CBSLP0DN79 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CBSLP0DN79 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CBSLP0DN79 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CBSLP0DN79 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CBSLP0DN79 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CBSLP0DN79 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CBSLP0DN79 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CBSLP0DN79 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CBSLP0DN79 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CBSLP0DN79 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CBSLP0DN79 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CBSLP0DN79 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CBSLP0DN79 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CBSLP0DN79 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CBSLP0DN79 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CBSLP0DN79 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CBSLP0DN79 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CBSLP0DN79 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CBSLP0DN79 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CBSLP0DN79 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CBSLP0DN79 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
CBSLP0DN79 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CBSLP0DN79 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CBSLP0DN79 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CBSLP0DN79 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CBSLP0DN79 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CBSLP0DN79 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CBSLP0DN79 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CBSLP0DN79 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CBSLP0DN79 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CBSLP0DN79 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CBSLP0DN79 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CBSLP0DN79 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CBSLP0DN79 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CBSLP0DN79 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CBSLP0DN79 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CBSLP0DN79 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
CBSLP0DN79 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CBSLP0DN79 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CBSLP0DN79 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CBSLP0DN79 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CBSLP0DN79 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CBSLP0DN79 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CBSLP0DN79 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CBSLP0DN79 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CBSLP0DN79 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CBSLP0DN79 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
CBSLP0DN79 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CBSLP0DN79 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CBSLP0DN79 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CBSLP0DN79 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CBSLP0DN79 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CBSLP0DN79 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CBSLP0DN79 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CBSLP0DN79 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CBSLP0DN79 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CBSLP0DN79 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CBSLP0DN79 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CBSLP0DN79 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
CBSLP0DN79 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CBSLP0DN79 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CBSLP0DN79 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CBSLP0DN79 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CBSLP0DN79 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CBSLP0DN79 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
CBSLP0DN79 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CBSLP0DN79 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CBSLP0DN79 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CBSLP0DN79 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CBSLP0DN79 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CBSLP0DN79 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CBSLP0DN79 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CBSLP0DN79 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CBSLP0DN79 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CBSLP0DN79 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CBSLP0DN79 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CBSLP0DN79 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CBSLP0DN79 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CBSLP0DN79 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CBSLP0DN79 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CBSLP0DN79 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CBSLP0DN79 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CBSLP0DN79 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CBSLP0DN79 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CBSLP0DN79 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CBSLP0DN79 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
CBSLP0DN79 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CBSLP0DN79 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CBSLP0DN79 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CBSLP0DN79 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CBSLP0DN79 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms