Protein–RNA interactions for Protein: P0DN76

U2AF1L5, Splicing factor U2AF 35 kDa subunit-like protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U2AF1L5P0DN76 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
U2AF1L5P0DN76 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
U2AF1L5P0DN76 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
U2AF1L5P0DN76 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
U2AF1L5P0DN76 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
U2AF1L5P0DN76 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
U2AF1L5P0DN76 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
U2AF1L5P0DN76 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
U2AF1L5P0DN76 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
U2AF1L5P0DN76 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
U2AF1L5P0DN76 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
U2AF1L5P0DN76 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
U2AF1L5P0DN76 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
U2AF1L5P0DN76 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
U2AF1L5P0DN76 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
U2AF1L5P0DN76 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC27.67■■■□□ 2.02
U2AF1L5P0DN76 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
U2AF1L5P0DN76 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
U2AF1L5P0DN76 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
U2AF1L5P0DN76 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
U2AF1L5P0DN76 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
U2AF1L5P0DN76 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
U2AF1L5P0DN76 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
U2AF1L5P0DN76 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
U2AF1L5P0DN76 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
U2AF1L5P0DN76 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
U2AF1L5P0DN76 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
U2AF1L5P0DN76 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
U2AF1L5P0DN76 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC27.65■■■□□ 2.02
U2AF1L5P0DN76 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
U2AF1L5P0DN76 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
U2AF1L5P0DN76 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
U2AF1L5P0DN76 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
U2AF1L5P0DN76 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
U2AF1L5P0DN76 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
U2AF1L5P0DN76 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
U2AF1L5P0DN76 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
U2AF1L5P0DN76 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
U2AF1L5P0DN76 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
U2AF1L5P0DN76 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
U2AF1L5P0DN76 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
U2AF1L5P0DN76 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
U2AF1L5P0DN76 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
U2AF1L5P0DN76 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
U2AF1L5P0DN76 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
U2AF1L5P0DN76 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
U2AF1L5P0DN76 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
U2AF1L5P0DN76 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC27.64■■■□□ 2.01
U2AF1L5P0DN76 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
U2AF1L5P0DN76 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
U2AF1L5P0DN76 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
U2AF1L5P0DN76 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
U2AF1L5P0DN76 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
U2AF1L5P0DN76 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
U2AF1L5P0DN76 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
U2AF1L5P0DN76 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
U2AF1L5P0DN76 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
U2AF1L5P0DN76 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
U2AF1L5P0DN76 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
U2AF1L5P0DN76 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
U2AF1L5P0DN76 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
U2AF1L5P0DN76 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
U2AF1L5P0DN76 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
U2AF1L5P0DN76 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
U2AF1L5P0DN76 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
U2AF1L5P0DN76 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
U2AF1L5P0DN76 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
U2AF1L5P0DN76 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
U2AF1L5P0DN76 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
U2AF1L5P0DN76 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
U2AF1L5P0DN76 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
U2AF1L5P0DN76 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
U2AF1L5P0DN76 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
U2AF1L5P0DN76 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
U2AF1L5P0DN76 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
U2AF1L5P0DN76 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
U2AF1L5P0DN76 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
U2AF1L5P0DN76 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
U2AF1L5P0DN76 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
U2AF1L5P0DN76 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
U2AF1L5P0DN76 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
U2AF1L5P0DN76 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
U2AF1L5P0DN76 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC27.62■■■□□ 2.01
U2AF1L5P0DN76 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
U2AF1L5P0DN76 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
U2AF1L5P0DN76 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
U2AF1L5P0DN76 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
U2AF1L5P0DN76 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
U2AF1L5P0DN76 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
U2AF1L5P0DN76 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
U2AF1L5P0DN76 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC27.61■■■□□ 2.01
U2AF1L5P0DN76 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
U2AF1L5P0DN76 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
U2AF1L5P0DN76 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
U2AF1L5P0DN76 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
U2AF1L5P0DN76 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
U2AF1L5P0DN76 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
U2AF1L5P0DN76 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
U2AF1L5P0DN76 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
U2AF1L5P0DN76 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms