Protein–RNA interactions for Protein: P07864

LDHC, L-lactate dehydrogenase C chain, humanhuman

Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LDHCP07864 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
LDHCP07864 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
LDHCP07864 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
LDHCP07864 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
LDHCP07864 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
LDHCP07864 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
LDHCP07864 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
LDHCP07864 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
LDHCP07864 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
LDHCP07864 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
LDHCP07864 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
LDHCP07864 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
LDHCP07864 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
LDHCP07864 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
LDHCP07864 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
LDHCP07864 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
LDHCP07864 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
LDHCP07864 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
LDHCP07864 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
LDHCP07864 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
LDHCP07864 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
LDHCP07864 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
LDHCP07864 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC24.89■■□□□ 1.58
LDHCP07864 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
LDHCP07864 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
LDHCP07864 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
LDHCP07864 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
LDHCP07864 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
LDHCP07864 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
LDHCP07864 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
LDHCP07864 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
LDHCP07864 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
LDHCP07864 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
LDHCP07864 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
LDHCP07864 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
LDHCP07864 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
LDHCP07864 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
LDHCP07864 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
LDHCP07864 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
LDHCP07864 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
LDHCP07864 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
LDHCP07864 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
LDHCP07864 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
LDHCP07864 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
LDHCP07864 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
LDHCP07864 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
LDHCP07864 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
LDHCP07864 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
LDHCP07864 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
LDHCP07864 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
LDHCP07864 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
LDHCP07864 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
LDHCP07864 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
LDHCP07864 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
LDHCP07864 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
LDHCP07864 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
LDHCP07864 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
LDHCP07864 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
LDHCP07864 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
LDHCP07864 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
LDHCP07864 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
LDHCP07864 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
LDHCP07864 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
LDHCP07864 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
LDHCP07864 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
LDHCP07864 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
LDHCP07864 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
LDHCP07864 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
LDHCP07864 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
LDHCP07864 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
LDHCP07864 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
LDHCP07864 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
LDHCP07864 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
LDHCP07864 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
LDHCP07864 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
LDHCP07864 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
LDHCP07864 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
LDHCP07864 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
LDHCP07864 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
LDHCP07864 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
LDHCP07864 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
LDHCP07864 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
LDHCP07864 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
LDHCP07864 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
LDHCP07864 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
LDHCP07864 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
LDHCP07864 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
LDHCP07864 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
LDHCP07864 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
LDHCP07864 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
LDHCP07864 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
LDHCP07864 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
LDHCP07864 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
LDHCP07864 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
LDHCP07864 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
LDHCP07864 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
LDHCP07864 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
LDHCP07864 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
LDHCP07864 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
LDHCP07864 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.4 ms