Protein–RNA interactions for Protein: P04554

PRM2, Protamine-2, humanhuman

Predictions only

Length 102 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRM2P04554 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRM2P04554 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRM2P04554 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRM2P04554 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRM2P04554 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRM2P04554 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRM2P04554 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRM2P04554 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRM2P04554 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRM2P04554 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRM2P04554 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRM2P04554 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRM2P04554 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRM2P04554 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRM2P04554 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRM2P04554 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRM2P04554 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRM2P04554 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRM2P04554 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRM2P04554 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRM2P04554 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRM2P04554 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRM2P04554 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRM2P04554 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRM2P04554 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRM2P04554 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRM2P04554 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRM2P04554 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRM2P04554 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRM2P04554 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRM2P04554 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRM2P04554 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRM2P04554 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRM2P04554 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRM2P04554 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRM2P04554 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
PRM2P04554 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRM2P04554 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRM2P04554 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRM2P04554 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRM2P04554 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRM2P04554 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRM2P04554 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRM2P04554 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRM2P04554 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRM2P04554 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRM2P04554 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRM2P04554 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
PRM2P04554 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRM2P04554 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRM2P04554 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRM2P04554 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRM2P04554 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
PRM2P04554 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRM2P04554 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRM2P04554 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRM2P04554 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRM2P04554 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
PRM2P04554 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRM2P04554 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRM2P04554 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRM2P04554 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRM2P04554 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PRM2P04554 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PRM2P04554 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PRM2P04554 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PRM2P04554 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PRM2P04554 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PRM2P04554 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PRM2P04554 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PRM2P04554 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PRM2P04554 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PRM2P04554 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PRM2P04554 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PRM2P04554 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PRM2P04554 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PRM2P04554 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PRM2P04554 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PRM2P04554 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PRM2P04554 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PRM2P04554 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PRM2P04554 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PRM2P04554 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PRM2P04554 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PRM2P04554 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PRM2P04554 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PRM2P04554 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PRM2P04554 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PRM2P04554 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PRM2P04554 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PRM2P04554 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PRM2P04554 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PRM2P04554 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PRM2P04554 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PRM2P04554 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PRM2P04554 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PRM2P04554 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PRM2P04554 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PRM2P04554 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
PRM2P04554 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms