Protein–RNA interactions for Protein: P04004

VTN, Vitronectin, humanhuman

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VTNP04004 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
VTNP04004 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
VTNP04004 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
VTNP04004 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
VTNP04004 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
VTNP04004 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
VTNP04004 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
VTNP04004 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
VTNP04004 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
VTNP04004 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
VTNP04004 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
VTNP04004 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
VTNP04004 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
VTNP04004 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
VTNP04004 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
VTNP04004 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
VTNP04004 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
VTNP04004 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
VTNP04004 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
VTNP04004 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
VTNP04004 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
VTNP04004 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
VTNP04004 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
VTNP04004 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
VTNP04004 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
VTNP04004 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
VTNP04004 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
VTNP04004 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
VTNP04004 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
VTNP04004 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
VTNP04004 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
VTNP04004 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
VTNP04004 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
VTNP04004 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
VTNP04004 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
VTNP04004 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
VTNP04004 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
VTNP04004 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
VTNP04004 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
VTNP04004 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
VTNP04004 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
VTNP04004 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
VTNP04004 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
VTNP04004 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
VTNP04004 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
VTNP04004 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
VTNP04004 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
VTNP04004 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
VTNP04004 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
VTNP04004 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
VTNP04004 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
VTNP04004 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
VTNP04004 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
VTNP04004 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
VTNP04004 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
VTNP04004 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
VTNP04004 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
VTNP04004 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
VTNP04004 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
VTNP04004 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
VTNP04004 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
VTNP04004 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
VTNP04004 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
VTNP04004 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
VTNP04004 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
VTNP04004 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
VTNP04004 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
VTNP04004 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
VTNP04004 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
VTNP04004 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
VTNP04004 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
VTNP04004 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
VTNP04004 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
VTNP04004 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
VTNP04004 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
VTNP04004 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
VTNP04004 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
VTNP04004 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
VTNP04004 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
VTNP04004 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
VTNP04004 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
VTNP04004 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
VTNP04004 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
VTNP04004 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
VTNP04004 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
VTNP04004 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
VTNP04004 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
VTNP04004 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
VTNP04004 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
VTNP04004 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
VTNP04004 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
VTNP04004 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
VTNP04004 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
VTNP04004 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
VTNP04004 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
VTNP04004 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
VTNP04004 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
VTNP04004 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
VTNP04004 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
VTNP04004 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms