Protein–RNA interactions for Protein: P01893

HLA-H, Putative HLA class I histocompatibility antigen, alpha chain H, humanhuman

Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-HP01893 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HLA-HP01893 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HLA-HP01893 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HLA-HP01893 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HLA-HP01893 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HLA-HP01893 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HLA-HP01893 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HLA-HP01893 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HLA-HP01893 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HLA-HP01893 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HLA-HP01893 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HLA-HP01893 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HLA-HP01893 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HLA-HP01893 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HLA-HP01893 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HLA-HP01893 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
HLA-HP01893 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
HLA-HP01893 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
HLA-HP01893 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
HLA-HP01893 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HLA-HP01893 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HLA-HP01893 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HLA-HP01893 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HLA-HP01893 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HLA-HP01893 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HLA-HP01893 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HLA-HP01893 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HLA-HP01893 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HLA-HP01893 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HLA-HP01893 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HLA-HP01893 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HLA-HP01893 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HLA-HP01893 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HLA-HP01893 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
HLA-HP01893 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HLA-HP01893 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HLA-HP01893 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HLA-HP01893 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HLA-HP01893 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HLA-HP01893 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HLA-HP01893 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HLA-HP01893 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
HLA-HP01893 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HLA-HP01893 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HLA-HP01893 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HLA-HP01893 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HLA-HP01893 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HLA-HP01893 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HLA-HP01893 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HLA-HP01893 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
HLA-HP01893 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HLA-HP01893 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HLA-HP01893 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HLA-HP01893 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HLA-HP01893 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HLA-HP01893 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HLA-HP01893 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HLA-HP01893 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HLA-HP01893 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HLA-HP01893 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HLA-HP01893 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HLA-HP01893 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HLA-HP01893 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HLA-HP01893 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HLA-HP01893 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HLA-HP01893 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HLA-HP01893 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HLA-HP01893 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HLA-HP01893 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HLA-HP01893 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HLA-HP01893 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HLA-HP01893 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HLA-HP01893 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HLA-HP01893 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HLA-HP01893 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
HLA-HP01893 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
HLA-HP01893 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HLA-HP01893 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HLA-HP01893 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HLA-HP01893 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HLA-HP01893 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HLA-HP01893 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HLA-HP01893 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HLA-HP01893 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HLA-HP01893 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HLA-HP01893 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HLA-HP01893 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HLA-HP01893 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HLA-HP01893 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HLA-HP01893 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HLA-HP01893 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HLA-HP01893 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HLA-HP01893 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
HLA-HP01893 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HLA-HP01893 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HLA-HP01893 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HLA-HP01893 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HLA-HP01893 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HLA-HP01893 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HLA-HP01893 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms