Protein–RNA interactions for Protein: P01762

IGHV3-11, Immunoglobulin heavy variable 3-11, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGHV3-11P01762 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
IGHV3-11P01762 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
IGHV3-11P01762 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
IGHV3-11P01762 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
IGHV3-11P01762 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
IGHV3-11P01762 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
IGHV3-11P01762 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
IGHV3-11P01762 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
IGHV3-11P01762 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
IGHV3-11P01762 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
IGHV3-11P01762 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
IGHV3-11P01762 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
IGHV3-11P01762 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
IGHV3-11P01762 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
IGHV3-11P01762 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
IGHV3-11P01762 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
IGHV3-11P01762 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
IGHV3-11P01762 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
IGHV3-11P01762 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
IGHV3-11P01762 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
IGHV3-11P01762 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
IGHV3-11P01762 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
IGHV3-11P01762 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
IGHV3-11P01762 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
IGHV3-11P01762 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
IGHV3-11P01762 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
IGHV3-11P01762 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
IGHV3-11P01762 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
IGHV3-11P01762 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
IGHV3-11P01762 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
IGHV3-11P01762 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
IGHV3-11P01762 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
IGHV3-11P01762 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
IGHV3-11P01762 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
IGHV3-11P01762 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
IGHV3-11P01762 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
IGHV3-11P01762 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
IGHV3-11P01762 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
IGHV3-11P01762 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
IGHV3-11P01762 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
IGHV3-11P01762 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
IGHV3-11P01762 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
IGHV3-11P01762 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
IGHV3-11P01762 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
IGHV3-11P01762 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
IGHV3-11P01762 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
IGHV3-11P01762 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
IGHV3-11P01762 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
IGHV3-11P01762 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
IGHV3-11P01762 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
IGHV3-11P01762 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
IGHV3-11P01762 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
IGHV3-11P01762 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
IGHV3-11P01762 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
IGHV3-11P01762 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
IGHV3-11P01762 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
IGHV3-11P01762 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
IGHV3-11P01762 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
IGHV3-11P01762 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
IGHV3-11P01762 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
IGHV3-11P01762 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
IGHV3-11P01762 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
IGHV3-11P01762 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
IGHV3-11P01762 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
IGHV3-11P01762 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
IGHV3-11P01762 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
IGHV3-11P01762 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
IGHV3-11P01762 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
IGHV3-11P01762 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
IGHV3-11P01762 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
IGHV3-11P01762 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
IGHV3-11P01762 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
IGHV3-11P01762 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
IGHV3-11P01762 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
IGHV3-11P01762 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
IGHV3-11P01762 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
IGHV3-11P01762 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
IGHV3-11P01762 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
IGHV3-11P01762 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
IGHV3-11P01762 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
IGHV3-11P01762 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
IGHV3-11P01762 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
IGHV3-11P01762 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
IGHV3-11P01762 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
IGHV3-11P01762 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
IGHV3-11P01762 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
IGHV3-11P01762 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
IGHV3-11P01762 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
IGHV3-11P01762 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
IGHV3-11P01762 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
IGHV3-11P01762 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
IGHV3-11P01762 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
IGHV3-11P01762 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
IGHV3-11P01762 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
IGHV3-11P01762 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
IGHV3-11P01762 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
IGHV3-11P01762 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
IGHV3-11P01762 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
IGHV3-11P01762 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
IGHV3-11P01762 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms